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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003452`

染色体: Chr04 坐标: 51005042-51009704 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003452`
名称	SmilChr04G003452
描述	uncharacterized SmilChr04G003452
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51005042 - 51009704 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020346`
GeneID	`131020346`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020346`
原始查询	`SmilChr04G003452`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0482500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os11g0482500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G68030` (AT1G68030) RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843131] identity=34.1; qcov=0.251; evalue=2.36e-08; confidence=weak
Rice	`Os11g0482500` - identity=35.2; qcov=0.33; evalue=6.03e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020346

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805080.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805080.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805080.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805080.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805080.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51005418`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,C68
`Chr4:51005945`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:51005990`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:51006260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C77
`Chr4:51006267`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr4:51006299`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	39	A1,A2,A6,B10,B124,B128,B17,B22,B3,B34,B37,B45,B5,B57,B58,B75,B77,B88,B93,B97,B98,C11,C13,C20,C28,C29,C33,C37,C39,C4,C50,C62,C63,C69,C73,C74,C84,C85,D6
`Chr4:51006338`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:51006358`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:51006373`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B105
`Chr4:51006373`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B105
`Chr4:51006392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:51006438`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949101.1
ATAAACTAACTACTCTCCAAGAGAGTGAGGGGCAGCAGATACAATCACTCACTATTCCAGACGCTAAACGAAGACGAAGCTGGAGATGAATCCACAGTCAAATCCTCGAAAGCCGCTCGTTTCCTCCCCTCACAGATGTATGTAGAGGAGTTGATGAAGTAAGTGAAGTTTTAGGGTACAGTTCAGGAAACAAAACTTGTCTTGGGAGCATGGGGCAAACCGGACCTCCTGGAGATGTCGAGTTTACTTCTTCAAAGGGG...

XM_057949100.1
CAAGAGAGTGAGGGGCAGCAGATACAATCACTCACTATTCCAGACGCTAAACGAAGACGAAGCTGGAGATGAATCCACAGTCAAATCCTCGAAAGCCGCTCGTTTCCTCCCCCAGTCACAGATGTATGTAGAGGAGTTGATGAAGTAAGTGAAGTTTTAGGGTACAGTTCAGGAAACAAAACTTGTCTTGGGAGCATGGGGCAAACCGGACCTCCTGGAGATGTCGAGTTTACTTCTTCAAAGGGGCTTCTAGGTCATGA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131020346
ATGTACATTGGTTGTGATGATCTGAGCAAAAACAACCGATATTGCTTGGCAACTAATCGCAGTGATCTGAATATTCTAGCAGTCACAGATGTATGTAGAGGAGTTGATGAAGTAAGTGAAGTTTTAGGGTACAGTTCAGGAAACAAAACTTGTCTTGGGAGCATGGGGCAAACCGGACCTCCTGGAGATGTCGAGTTTACTTCTTCAAAGGGGCTTCTAGGTCATGACAAAGAGATGCATCGTTCTAAGCAAGACCCTGA...

LOC131020346
ATGGGGCAAACCGGACCTCCTGGAGATGTCGAGTTTACTTCTTCAAAGGGGCTTCTAGGTCATGACAAAGAGATGCATCGTTCTAAGCAAGACCCTGAAAATGGAAATGCAGGTGAAAGTGCATGTTTCCTTGAAAGAAACACGTCTAGCGGATGCAAGGATGGGTTTGAGCAAGAAATTCATAGAAATGTTATAGATCTTGACGATGCTGAAGATGTTGTTGTTTCTGGTGATAGTAATGGGTGTCTTAATGAGAGGAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057805080.1
MYIGCDDLSKNNRYCLATNRSDLNILAVTDVCRGVDEVSEVLGYSSGNKTCLGSMGQTGPPGDVEFTSSKGLLGHDKEMHRSKQDPENGNAGESACFLERNTSSGCKDGFEQEIHRNVIDLDDAEDVVVSGDSNGCLNERTDIATKKLAFLSSQCSFIQGSVDCKDLNVCVKCNKGGELKVCSSTNSCRLVVHESCSDSHMSFSTRGEFQCPFCAYSQALSEYMYIKKKVSLTQKDFVTFVCLEARKELKKQPCRSYRSK...

XP_057805083.1
MGQTGPPGDVEFTSSKGLLGHDKEMHRSKQDPENGNAGESACFLERNTSSGCKDGFEQEIHRNVIDLDDAEDVVVSGDSNGCLNERTDIATKKLAFLSSQCSFIQGSVDCKDLNVCVKCNKGGELKVCSSTNSCRLVVHESCSDSHMSFSTRGEFQCPFCAYSQALSEYMYIKKKVSLTQKDFVTFVCLEARKELKKQPCRSYRSKQHRSEHNDSVYISIDPNNQDNSKHINNQKRRRKLEFQEAGCSTLSSGDHSPSRG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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