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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003459`

染色体: Chr04 坐标: 51063886-51065174 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003459`
名称	SmilChr04G003459
描述	uncharacterized SmilChr04G003459
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51063886 - 51065174 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023575`
GeneID	`131023575`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023575`
原始查询	`SmilChr04G003459`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=weak
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=23.4; qcov=1.07; evalue=4.18e-17; confidence=weak
Rice	`Os01g0967700` - identity=23.4; qcov=0.838; evalue=5.96e-10; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023575

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809101.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057809101.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057809101.1`
4	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057809101.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809101.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51063929`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	45	A1,A13,A14,A16,A23,A7,A8,B100,B107,B11,B120,B125,B138,B139,B18,B21,B25,B27,B30,B35,B45,B5,B50,B51,B54,B59,B7,B8,B86,B94,C18,C23,C26,C35,C4,C58,C60,C63,C70,C77,C83,C86,C87,C9,D9
`Chr4:51063932`	`TCC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	45	A1,A13,A14,A16,A23,A7,A8,B100,B107,B11,B120,B125,B138,B139,B18,B21,B25,B27,B30,B35,B45,B5,B50,B51,B54,B59,B7,B8,B86,B94,C18,C23,C26,C35,C4,C58,C60,C63,C70,C77,C83,C86,C87,C9,D9
`Chr4:51063938`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B9
`Chr4:51063966`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	B104,B109,B113,B121,B130,B20,B26,B41,B44,B47,B48,B52,B53,B59,B6,B63,B76,C16,C67,D10
`Chr4:51063999`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B9,C77
`Chr4:51064007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:51064017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C24,C9
`Chr4:51064041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:51064065`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B127,B28,B71,B77,C33
`Chr4:51064071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B135,B5,B64,B83,D10
`Chr4:51064076`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A10
`Chr4:51064076`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809101.1

352 aa

176

352

RVT_3

PF13456 RVT_3 243-352 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809101.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	243	352	2.9e-13	50.5	Reverse transcriptase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953118.1
ATGGGAATTTCCTTACGGCTAAGATTGGTGCGAGCTATTGACTCTTTTCGGATTTCTGCTCCTGCTCCCCCAGAGCTTGTGGACTTCACTGTTAAGGAAGCTCTTCTTCCAGGTACCTGCTCTTGGAATGTCCAGTTGCTTCAGTTTCTTGTTGGTGAATATGACCTCAAAGCTATTGTTAACATTCCAGTGCTTCCTGAAGCGGGCCCGGACAAACTTGTTTGGCACTTTTCTAATCATGGGCATTACACTGTCAAATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023575
ATGGGAATTTCCTTACGGCTAAGATTGGTGCGAGCTATTGACTCTTTTCGGATTTCTGCTCCTGCTCCCCCAGAGCTTGTGGACTTCACTGTTAAGGAAGCTCTTCTTCCAGGTACCTGCTCTTGGAATGTCCAGTTGCTTCAGTTTCTTGTTGGTGAATATGACCTCAAAGCTATTGTTAACATTCCAGTGCTTCCTGAAGCGGGCCCGGACAAACTTGTTTGGCACTTTTCTAATCATGGGCATTACACTGTCAAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809101.1
MGISLRLRLVRAIDSFRISAPAPPELVDFTVKEALLPGTCSWNVQLLQFLVGEYDLKAIVNIPVLPEAGPDKLVWHFSNHGHYTVKSAYHLASSVTLDDSYKVEGQWGKLWKSDVPPKNLWHVFLFCPFAEDCWRASHLQAFISNIISGSDSFVMALFLIIGSSNEDVKTKVCMLFWQIWKERNAVVWNESNLVPSSSMVAAVVTCADWKLARSVAAHLSARQQPTAPCLGWHAIPADSVRCNVDAAFFEQDQTMEIGIV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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