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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003461`

染色体: Chr04 坐标: 51086756-51093396 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003461`
名称	SmilChr04G003461
描述	protein LEO1 homolog
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51086756 - 51093396 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020355`
GeneID	`131020355`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020355`
原始查询	`SmilChr04G003461`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein LEO1 homolog
产物	protein LEO1 homolog
Arabidopsis	`AT5G61150` (VIP4) leo1-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836236] identity=56.1; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0579000` - identity=50.5; qcov=1.06; evalue=2.14e-169; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0006368 (transcription elongation by RNA polymerase II); GO:0016570 (GO:0016570); GO:0016593 (Cdc73/Paf1 complex); GO:0032968 (positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II); GO:1990269 (RNA polymerase II C-terminal domain phosphoserine binding)
KEGG	-
Pfam	PF04004 (Leo1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020355

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805093.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057805093.1`
3	Nuclear body	核内小体	0.80000	`XP_057805093.1`
4	Nuclear speckle	核斑点	0.80000	`XP_057805093.1`
5	Nucleolar fibrillar center	Nucleolar fibrillar center	0.40000	`XP_057805093.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51087056`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr4:51089770`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,D7
`Chr4:51092477`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:51092994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B23
`Chr4:51092994`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805093.1

628 aa

314

628

Leo1

PF04004 Leo1 264-423 aa

XP_057805094.1

628 aa

314

628

Leo1

PF04004 Leo1 264-423 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805093.1`	Pfam	`PF04004`	Leo1	Family	264	423	9.5e-48	162.9	Leo1-like protein
`XP_057805094.1`	Pfam	`PF04004`	Leo1	Family	264	423	9.5e-48	162.9	Leo1-like protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949111.1
CTTAAGAATTCCTTGGGGCGAGACCGAATAGAGGGTTTAAATGTTTAATACTACCATTATTCTATTTCCGAACCTTTTTTCGATATGATTCGAAATTGAGACACATACAAACCCCCAATTAACGCACACAACACATAGTTACAGCACTTTTTTCCTTCTCCGGAGCAGCCGCAAATTCTCTTGCCCCACGCACCAAATTACACACAGAGAACACGCAGTAACGATGGTTGGAGAGGAGAAGCGGCATCAGATGATGCAGA...

XM_057949110.1
CTTAAGAATTCCTTGGGGCGAGACCGAATAGAGGGTTTAAATGTTTAATACTACCATTATTCTATTTCCGAACCTTTTTTCGATATGATTCGAAATTGAGACACATACAAACCCCCAATTAACGCACACAACACATAGTTACAGCACTTTTTTCCTTCTCCGGAGCAGCCGCAAATTCTCTTGCCCCACGCACCAAATTACACACAGAGAACACGCAGTAACGATGGTTGGAGAGGAGAAGCGGCATCAGATGATGCAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020355
ATGGTTGGAGAGGAGAAGCGGCATCAGATGATGCAGAATTTGTTCGGTGACCAATCAGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAGGAGGAGGTTGAATCAGAGCACGAGTCTAATCGTCAACCTGATTATGCATCCGATGAAGGGGATGAAGGACCTGAGGCTGAAGGTGAAGGTGAAGTTGAAGGTCAAGGGGAGGCAGAAATTGAGAGTGAGGGTGAACCTCAGGATCTTGATCCTTTACAAGGTGAGAGTGAGGGTGAGAGAGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805093.1
MVGEEKRHQMMQNLFGDQSEEEEEEEEEVESEHESNRQPDYASDEGDEGPEAEGEGEVEGQGEAEIESEGEPQDLDPLQGESEGERDKSSQELEIGNQREQSEERYSESDDKEDYGQRVVTSRRHDAVESGSERSGENHYVANEDDEVNQARSHSVSGDEKDEDQFLQSAPEIRDVFGDSDDEELAEYKVQDQTEEDEVRSPIEEMGNYGKDLRPEDMIPDEDAPYYSEEEHIEARAKEKPVGPPLELEIPLCPPPSESE...

XP_057805094.1
MVGEEKRHQMMQNLFGDQSEEEEEEEEEVESEHESNRQPDYASDEGDEGPEAEGEGEVEGQGEAEIESEGEPQDLDPLQGESEGERDKSSQELEIGNQREQSEERYSESDDKEDYGQRVVTSRRHDAVESGSERSGENHYVANEDDEVNQARSHSVSGDEKDEDQFLQSAPEIRDVFGDSDDEELAEYKVQDQTEEDEVRSPIEEMGNYGKDLRPEDMIPDEDAPYYSEEEHIEARAKEKPVGPPLELEIPLCPPPSESE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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