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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003467`

染色体: Chr04 坐标: 51153297-51161919 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003467`
名称	SmilChr04G003467
描述	histone deacetylase 5-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51153297 - 51161919 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023576`
GeneID	`131023576`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023576`
原始查询	`SmilChr04G003467`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone deacetylase 5-like
产物	histone deacetylase 5-like
Arabidopsis	`AT5G61060` (HDA05) histone deacetylase 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836227] identity=65.5; qcov=0.705; evalue=9.22e-177; confidence=high
Rice	`Os07g0602200` - identity=63.7; qcov=0.697; evalue=1.66e-170; confidence=high
GO	GO:0000118 (histone deacetylase complex); GO:0004407 (histone deacetylase activity); GO:0006325 (chromatin organization); GO:0016575 (GO:0016575)
KEGG	-
Pfam	PF00850 (Hist_deacetyl)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023576

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809102.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057809102.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057809102.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809102.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809102.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51153449`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B91,C21,D11
`Chr4:51153480`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	65	A11,A13,A2,A22,A5,A6,B102,B103,B108,B11,B113,B115,B12,B122,B123,B124,B128,B131,B137,B138,B15,B16,B18,B2,B24,B29,B3,B32,B43,B44,B45,B51,B52,B54,B58,B6,B88,B89,B9,B93,B97,B99,C15,C22,C23,C25,C26,C3,C32,C33,C37,C41,C45,C46,C51,C55,C56,C64,C66,C67,C68,C77,C8,D6,D8
`Chr4:51153917`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	B10,B13,B14,B35,B65,B92,C59,C63,C87
`Chr4:51153919`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B10,B13,B14,B35,B65,B92,C59,C63,C87
`Chr4:51153963`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr4:51153997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B76,C16
`Chr4:51154012`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B91,C21,D11
`Chr4:51154298`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr4:51154299`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B33
`Chr4:51154299`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B33
`Chr4:51154332`	`C`	`CG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B20
`Chr4:51154332`	`C`	`CG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B20

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809102.1

509 aa

254

509

Hist_deacetyl

PF00850 Hist_deacetyl 35-336 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809102.1`	Pfam	`PF00850`	Hist_deacetyl	Domain	35	336	2.4e-97	326.6	Histone deacetylase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953119.1
GAGCGCCAAAGAAAAGGATTCTCTCACTTCCTCTCTCCTCTGTACAGTTTGACTGTGTGAGTGTGTTGTTCCACCGGCAAAATTCAAACTTGGGCTTGTCACCGCCAAGAAAGAAAAACAAAGAAAAGAAGAAAATGAGCAGAAGTAGCGACGACAGTGTTAGCACTAGAAACCAGCGGGTGGGTTTGATATTTGACGAGCGGATGTATAAACACTACGCTCCTCATGAAAAGGATCATGTTGAATGCCCTGATCGAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023576
ATGAGCAGAAGTAGCGACGACAGTGTTAGCACTAGAAACCAGCGGGTGGGTTTGATATTTGACGAGCGGATGTATAAACACTACGCTCCTCATGAAAAGGATCATGTTGAATGCCCTGATCGAATTCGGGTCATCTGGGACCTCCTCAATTCTTCTGGCCTCGCCAAAAGGTGTATTATTTTGAAGGCCAAGGCCGCAGAAGATAATCATTTAGCCTTGGTTCACACCAAAAACCATATCACTTTGATTAAGAATATTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809102.1
MSRSSDDSVSTRNQRVGLIFDERMYKHYAPHEKDHVECPDRIRVIWDLLNSSGLAKRCIILKAKAAEDNHLALVHTKNHITLIKNISSKNTKSKRKRIAEKFDSIYFNEGSTEAACLAAGSVIEAAEKVAKGEIDSAFAIVRPPGHHAEEGEPMGFCLYNNVAIAASYLLNERQELGINKILIVDWDVHHGNGTQKMFYKDPRVLVFSVHRHDFGTFYPTGDDGSYIMTGEGAGAGHNINVPWEHGKCGDADYLAVWDHI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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