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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003483`

染色体: Chr04 坐标: 51281707-51292148 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003483`
名称	SmilChr04G003483
描述	formin-like protein 20
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51281707 - 51292148 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020376`
GeneID	`131020376`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020376`
原始查询	`SmilChr04G003483`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	formin-like protein 20
产物	formin-like protein 20
Arabidopsis	`AT5G07740` (AT5G07740) actin binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3770686] identity=61.4; qcov=0.38; evalue=0; confidence=low
Rice	`Os07g0596300` (BUI1) - identity=73.5; qcov=0.276; evalue=0; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02181 (FH2); PF10409 (PTEN_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020376

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057805126.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057805126.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.60000	`XP_057805127.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805126.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805126.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51283555`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr4:51284160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:51284563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr4:51284716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D11
`Chr4:51284739`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:51285132`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B94,C23,C8
`Chr4:51285181`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,D7
`Chr4:51285235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:51285249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:51285253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr4:51285893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr4:51285899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805126.1

1564 aa

782

1564

PTEN_C2

FH2

PF10409 PTEN_C2 199-339 aa PF02181 FH2 1159-1526 aa

XP_057805127.1

1520 aa

760

1520

PTEN_C2

FH2

PF10409 PTEN_C2 199-339 aa PF02181 FH2 1115-1482 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805126.1`	Pfam	`PF10409`	PTEN_C2	Domain	199	339	9.6e-35	119.9	C2 domain of PTEN tumour-suppressor protein
`XP_057805126.1`	Pfam	`PF02181`	FH2	Family	1159	1526	1e-114	384.3	Formin Homology 2 Domain
`XP_057805127.1`	Pfam	`PF10409`	PTEN_C2	Domain	199	339	9.2e-35	120.0	C2 domain of PTEN tumour-suppressor protein
`XP_057805127.1`	Pfam	`PF02181`	FH2	Family	1115	1482	9.4e-115	384.4	Formin Homology 2 Domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100681.1
TTACTCGTTGTCAACATTTAGCCACGTGAGTTCCACATCCCACCAGAAGAGCAATCCGTCCAAAAACAAATGAAAGCAGAGTTGGAAAAGAAAACAACAATTTCAAGAAATCGACAAACGCAAAGTCGGGTCCTATTCACTGTTTATCCGGGTCGGATCTGTCTCCCCCCCTTACGGCTATCCTTTCACCTTTTCAGTCCCACTACGTTTCCCCCCTTTCTCTCTCTACAACTCTTTCTCTCTCTCTTTACCCCCCATGT...

XM_057949144.1
TTACTCGTTGTCAACATTTAGCCACGTGAGTTCCACATCCCACCAGAAGAGCAATCCGTCCAAAAACAAATGAAAGCAGAGTTGGAAAAGAAAACAACAATTTCAAGAAATCGACAAACGCAAAGTCGGGTCCTATTCACTGTTTATCCGGGTCGGATCTGTCTCCCCCCCTTACGGCTATCCTTTCACCTTTTCAGTCCCACTACGTTTCCCCCCTTTCTCTCTCTACAACTCTTTCTCTCTCTCTTTACCCCCCATGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020376
ATGGCGCTGTTCAGAAGGTTCTTCTACCGGAAGCCGCCCGATCGGCTTCTCGAGATCTCCGAGAGGGTCTACGTGTTTGATTGTTGCTTCTCCACCGATGTACTTGACGAAGATGAGTACAGAACGTATATGAATGGGATTGTTGCTCAGTTACAGGACCACTACCCCGATGCTGCTTTTATGGTTTTCAATTTCAAAGAAGGTGAAAGGAGAAGCCAATTATCCGATGTGTTATCTCAGTATGACATGACAGTAATGGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805126.1
MALFRRFFYRKPPDRLLEISERVYVFDCCFSTDVLDEDEYRTYMNGIVAQLQDHYPDAAFMVFNFKEGERRSQLSDVLSQYDMTVMDYPRQYEGCPLLPLEMIHHFLRSSESWLSLEGQQNVLLMHCERGGWPVLAFMLAGLLLYRKQYTGEQKTLEMVYKQAPRELLHLLSPLNPQPSQLRYLQYISRRNIGSDWPPSDTPLALDCIILRILPLYDGGRGCRPVIRVYGQDPASKASTRSSKLLFSTSKIQKKIRLYKQ...

XP_057805127.1
MALFRRFFYRKPPDRLLEISERVYVFDCCFSTDVLDEDEYRTYMNGIVAQLQDHYPDAAFMVFNFKEGERRSQLSDVLSQYDMTVMDYPRQYEGCPLLPLEMIHHFLRSSESWLSLEGQQNVLLMHCERGGWPVLAFMLAGLLLYRKQYTGEQKTLEMVYKQAPRELLHLLSPLNPQPSQLRYLQYISRRNIGSDWPPSDTPLALDCIILRILPLYDGGRGCRPVIRVYGQDPASKASTRSSKLLFSTSKIQKKIRLYKQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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