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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003484`

染色体: Chr04 坐标: 51293370-51294314 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003484`
名称	SmilChr04G003484
描述	uncharacterized SmilChr04G003484
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51293370 - 51294314 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023580`
GeneID	`131023580`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023580`
原始查询	`SmilChr04G003484`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836255]; symbol=AT5G61340; hit=AT5G61340; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836255]; symbol=AT5G61340; hit=AT5G61340; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G61340` (AT5G61340) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836255] identity=43.3; qcov=1; evalue=2.33e-64; confidence=medium
Rice	`Os12g0577200` - identity=35.5; qcov=1.08; evalue=7.43e-42; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29520 (DUF8558)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023580

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057809107.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057809107.1`
3	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057809107.1`
4	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057809107.1`
5	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057809107.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51293851`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C42
`Chr4:51293905`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B71,C27
`Chr4:51293905`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B71,C27
`Chr4:51293936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr4:51293994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B46,B70,B85,C38
`Chr4:51294008`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C63,C78,C87,C9
`Chr4:51294011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr4:51294189`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B137,B24,B38,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809107.1

314 aa

157

314

DUF8558

PF29520 DUF8558 26-291 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809107.1`	Pfam	`PF29520`	DUF8558	Domain	26	291	1.8e-09	38.1	Domain of unknown function (DUF8558)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953124.1
ATGAGTCCATCAAGAATCATGCGAAAATCCATCTTCACATTCCTTCAAAACTTCCAGCAGCTCTCCTCCGCCCCCTCCCTCCTCCTCCTCCCCTTCGCCGCCTCCATCCTCCTCTCCCCGCCCCTCGTGGCCTCGTCCCGCCTCTTCCCTTTAATCCACGGCCGCCTCCGCTCAGTGTTCCTGGCCGCCGGCATCCCGCCCCAATCGGAACTCTTCGCCATACTCAACCTCAAGCTCGCCCAAACCATCCTCTCCTTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023580
ATGAGTCCATCAAGAATCATGCGAAAATCCATCTTCACATTCCTTCAAAACTTCCAGCAGCTCTCCTCCGCCCCCTCCCTCCTCCTCCTCCCCTTCGCCGCCTCCATCCTCCTCTCCCCGCCCCTCGTGGCCTCGTCCCGCCTCTTCCCTTTAATCCACGGCCGCCTCCGCTCAGTGTTCCTGGCCGCCGGCATCCCGCCCCAATCGGAACTCTTCGCCATACTCAACCTCAAGCTCGCCCAAACCATCCTCTCCTTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809107.1
MSPSRIMRKSIFTFLQNFQQLSSAPSLLLLPFAASILLSPPLVASSRLFPLIHGRLRSVFLAAGIPPQSELFAILNLKLAQTILSFAFSLPFSLSFLLLAKAAVIRLLHRHKPNSFLSLISTLNRLVATHICNSLLILSANATCFCLLAAAFNCADVLSLSSPRFRLLLSATGAIAYSIVLANAYIVCGIALIASAVDADGGGGLSSILEACALIRGRTSAALSLAVPMNMALAAVEALFQYRIFNAYSRETAVTPPMVL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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