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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003489`

染色体: Chr04 坐标: 51341850-51345321 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003489`
名称	SmilChr04G003489
描述	probable xyloglucan 6-xylosyltransferase 5
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51341850 - 51345321 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020379`
GeneID	`131020379`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020379`
原始查询	`SmilChr04G003489`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable xyloglucan 6-xylosyltransferase 5
产物	probable xyloglucan 6-xylosyltransferase 5
Arabidopsis	`AT5G07720` (XXT3) Galactosyl transferase GMA12/MNN10 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830665] identity=75.4; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0529600` (OsGT2) - identity=67.2; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005768 (endosome); GO:0005802 (trans-Golgi network); GO:0009969 (xyloglucan biosynthetic process); GO:0016020 (membrane); GO:0016758 (hexosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF05637 (Glyco_transf_34)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020379

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057805131.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057805131.1`
3	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057805131.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805131.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805131.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51343816`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B106,C48,C60,C80
`Chr4:51343993`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B46,B70,B85,C38
`Chr4:51344077`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B22,C37,C80
`Chr4:51344254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:51344327`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B117,C8
`Chr4:51344692`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B68
`Chr4:51344692`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B68
`Chr4:51344850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B4,C19,C71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805131.1

456 aa

228

456

Glyco_transf_34

PF05637 Glyco_transf_34 148-385 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805131.1`	Pfam	`PF05637`	Glyco_transf_34	Family	148	385	5.2e-61	207.1	galactosyl transferase GMA12/MNN10 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949148.1
AAAAAAAATGCTTCACACAGACGCGTGAAATCCAGCCCATAAACAGCGGCTTTGTCGCCCCCATTCATCGCCGTCGTCGTATTATATTATTCAATTTCCAAACTGACCCCCTCAAAAATTGATTAAAAAATTCAAATCCCCCAATTAAATTAATCTAAGAAGCCATTAGAAAAAGAAAAGAAGAAAGAAAAACCGAAACGCAGTCGGTGCTGCTTCCTTCTTCATCTCCACTTCCTCTTCTCCACATTCATCCCATTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020379
ATGGGATCGGAGGGAGCGTTCTCCGCTCAGAAACGGGGCTCCGGCGGGCTTCCGACGGCCAACGCCGCCGTGAACGGAGGAGCGCGCAGCCGTGCCGCGTCTCTGCTGCCGCGGGGGCGGCAGATCCACAAGACGTTCAACAACATTAAGATCACTATCCTTTGCGGCTTCGTCACGATTCTGGTGCTTCGCGGCACAATCGGGCTCGGGAACCTCGTTTCTTCGGAAGCTGACGCGGAGAATCAGCATCTGATTGAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805131.1
MGSEGAFSAQKRGSGGLPTANAAVNGGARSRAASLLPRGRQIHKTFNNIKITILCGFVTILVLRGTIGLGNLVSSEADAENQHLIEETNRILAEIRSDKDPTDPDDGPEQFLGLNDTFSLGPRISTWDQDRKVWLEKNPQFPSYVNGKPRFLLVTGSQPTPCDNAIGDHYLLKALKNKIDYCRLHGIEIVYNMAHLDKELAGYWAKLPLLRRLMLSHPEVEWIWWMDSDALFTDMVFEIPVSKYKDHNMVIHGYPDLLFE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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