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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003495`

染色体: Chr04 坐标: 51379546-51383178 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003495`
名称	SmilChr04G003495
描述	galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51379546 - 51383178 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020387`
GeneID	`131020387`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020387`
原始查询	`SmilChr04G003495`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase-like
产物	galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase-like
Arabidopsis	`AT2G03220` (FT1) fucosyltransferase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:814851] identity=59.8; qcov=0.928; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0764400` (OsSTA79) - identity=58.7; qcov=0.862; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005794 (Golgi apparatus); GO:0008107 (galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase activity); GO:0009969 (xyloglucan biosynthetic process); GO:0016020 (membrane); GO:0042546 (cell wall biogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF03254 (XG_FTase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020387

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057805137.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057805137.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805137.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805137.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805137.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51379786`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr4:51379845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,D11
`Chr4:51381551`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr4:51381580`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:51381618`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B37
`Chr4:51381618`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B37
`Chr4:51381694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:51381815`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C14
`Chr4:51381941`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B120
`Chr4:51381953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:51382070`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:51382237`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805137.1

571 aa

286

571

XG_FTase

PF03254 XG_FTase 92-540 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805137.1`	Pfam	`PF03254`	XG_FTase	Family	92	540	1e-208	694.5	Xyloglucan fucosyltransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949154.1
CGTTTAAATACAGCAGCAAAGCAGAGTCAAAACCTAAAAACCCCCCACACACACTCACACACACCAATACATGAAGTGCAGCAAAACTCATTCAAGATCATCGTACAAACTATGGTGATTGGTCTCCATACCAACATCCCTGAAATTTCTATGTGACAAAATACCTCATTTTTCGTATTAAACTGCGGAAATGAAGAGGCTGAACGGCAAAGCCATGGCCGCTAACTTCGGCGGCCAACCCGAGCCGGGCAGCGATCACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020387
ATGAAGAGGCTGAACGGCAAAGCCATGGCCGCTAACTTCGGCGGCCAACCCGAGCCGGGCAGCGATCACGGCGCCGACGCAGTCAGCTGGGGCCCAGAGCGGAAATGTGGGTTGAATCTCATGAAATTGATGGGTGTATTTCTCGTTTTGGTGATGGGTTTCTCCGTTTTGTTCTCGGTCTCCGTCGTGCTGAGGGACCCGCCGTCGGATGCGTTTTGGACCGTGGTTGAAGCCCGGAATCTTGATTTTAACCTTCAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805137.1
MKRLNGKAMAANFGGQPEPGSDHGADAVSWGPERKCGLNLMKLMGVFLVLVMGFSVLFSVSVVLRDPPSDAFWTVVEARNLDFNLQKAIIEENNHAQPVEVPKDKLLGDLLPAGFDEKSCLSQYQSLLYRRGVPQKASSYLISKLRSYEARHKKCGPYTNSYNKTVEDLKSGRHSSTPECSYLVWISFSGLGNRMLTLTSAFLYALLTDRVLLVDRGVDIHDLFCEPFPEASWLLPLDFPLTNEFSSFNQSSHQSYGNVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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