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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003512`

染色体: Chr04 坐标: 51479564-51481536 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003512`
名称	SmilChr04G003512
描述	cyclic dof factor 1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51479564 - 51481536 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020403`
GeneID	`131020403`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020403`
原始查询	`SmilChr04G003512`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cyclic dof factor 1-like
产物	cyclic dof factor 1-like
Arabidopsis	`AT5G62430` (CDF1) cycling DOF factor 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836364] identity=44.8; qcov=0.889; evalue=2.66e-67; confidence=medium
Rice	`Os03g0169600` (RDD4) - identity=51; qcov=0.473; evalue=2.45e-42; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02701 (Zn_ribbon_Dof)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020403

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805164.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805164.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805164.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805164.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805164.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51479766`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr4:51479767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,C80
`Chr4:51479783`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C2
`Chr4:51479855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B99
`Chr4:51480030`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B33,B63,C12,C53
`Chr4:51480103`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	34	A10,A6,B10,B102,B103,B108,B131,B139,B20,B24,B37,B45,B46,B51,B52,B66,B67,B7,B75,B85,B93,C10,C15,C2,C42,C46,C51,C56,C64,C66,C73,C74,C85,D4
`Chr4:51480160`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15
`Chr4:51481244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B114
`Chr4:51481244`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805164.1

332 aa

166

332

Zn_ribbon_Dof

PF02701 Zn_ribbon_Dof 105-161 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805164.1`	Pfam	`PF02701`	Zn_ribbon_Dof	Family	105	161	2.2e-32	111.7	Dof domain, zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949181.1
ATTCAATATTTCTACAAAGATATCAAAATCATTCCATCTAGCCTTGCCAACGAAGCTTTTTCTCCCTTTTTTTCACAATCTTTTTCTGAATCACTTCATTTTGGAGATTTCAGCTTGCTTCTCACTCTGAGATTAGTAGCGAAGAGAGATGAAGATGCTGAATGAGCCGGAGATTAAGCTGTTCGGCCGGAAGATTTATTTTCCGGAGAACGGCGCCGTCGGAGAACGTTCCGGTGAGTGGTCCAACGAAAGTAGTGGCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020403
ATGAAGATGCTGAATGAGCCGGAGATTAAGCTGTTCGGCCGGAAGATTTATTTTCCGGAGAACGGCGCCGTCGGAGAACGTTCCGGTGAGTGGTCCAACGAAAGTAGTGGCGATTGCGATCGCTGCTTGGAACAGAGCAAAGGGCAAGACGGAGAAGAAGTTGGAAGGAAGGAAAAGCAGGAGCAGAGAGATGAGGAGATAGCAGAAGGAGAAATCTGTGAAACTAGTGCAGAAAATGAGGAATCAGATGGTGGATCGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805164.1
MKMLNEPEIKLFGRKIYFPENGAVGERSGEWSNESSGDCDRCLEQSKGQDGEEVGRKEKQEQRDEEIAEGEICETSAENEESDGGSESNTKTENSEQKTLKKPDKIIPCPRCKSMDTKFCYYNNYNVNQPRHFCKSCQRYWTAGGTMRNVPVGAGRRKNKNCRHVAADGFHNLSFNPTATATATVLSFSHQTDNDRSSIANQPAAMLPWPFPWNSAVFPPSPMPYYLWNSGGWALGKHPRSGEVVDPQGQKRRSSIVVPK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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