当前解析结果
SmilChr04G003514| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003514 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003514 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G003514 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 51512162 - 51514885 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020399 |
|---|---|
| GeneID | 131020399 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020399 |
| 原始查询 | SmilChr04G003514 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | DWA1; symbol=DWA1; hit=Os04g0473900; species=rice; confidence=high |
| 产物 | DWA1; symbol=DWA1; hit=Os04g0473900; species=rice; confidence=high |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os04g0473900 (DWA1)- identity=60.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0020037 (heme binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020399 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Mitochondrion | 线粒体 | 0.80000 | XP_057805159.1 |
| 2 | Mitochondrion membrane | 线粒体膜 | 0.40000 | XP_057805159.1 |
| 3 | Mitochondrion outer membrane | 线粒体外膜 | 0.40000 | XP_057805159.1 |
| 4 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.20000 | XP_057805159.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057805159.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:51512196 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B4,C5 |
Chr4:51512254 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr4:51512262 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr4:51512345 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C84 |
Chr4:51512379 |
T |
TTC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 12 | B117,B122,B140,B42,B43,C24,C32,C39,C68,C79,C85,D7 |
Chr4:51512435 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B59,B86 |
Chr4:51512493 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B35,C21 |
Chr4:51512524 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B119,B22,C60,C84 |
Chr4:51512599 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B22,C80 |
Chr4:51512599 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B22,C80 |
Chr4:51512632 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr4:51512655 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B71 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。