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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003543`

染色体: Chr04 坐标: 51783982-51796618 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003543`
名称	SmilChr04G003543
描述	uncharacterized SmilChr04G003543
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51783982 - 51796618 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020427`
GeneID	`131020427`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020427`
原始查询	`SmilChr04G003543`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os07g0180800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os07g0180800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G44710` (AT2G44710) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819079] identity=36; qcov=0.376; evalue=1.01e-57; confidence=low
Rice	`Os07g0180800` - identity=48.6; qcov=0.357; evalue=3.13e-93; confidence=low
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020427

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805193.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805193.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805193.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805193.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805193.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51784638`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	A25,B36
`Chr4:51784638`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	A25,B36
`Chr4:51784669`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	117	A15,A23,A24,A25,A6,B10,B101,B104,B106,B108,B109,B110,B112,B114,B119,B122,B123,B124,B125,B127,B128,B133,B134,B136,B137,B14,B140,B16,B19,B23,B25,B28,B29,B32,B34,B36,B41,B45,B47,B50,B52,B56,B57,B58,B6,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B71,B74,B75,B76,B77,B80,B82,B87,B88,B90,B91,B92,B93,B96,B97,C10,C11,C12,C15,C16,C17,C2,C20,C22,C23,C24,C25,C28,C33,C34,C36,C37,C38,C39,C40,C41,C43,C44,C45,C47,C48,C5,C50,C51,C60,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C69,C7,C70,C73,C74,C79,C8,C82,C83,C84,C87,D11,D7,D9
`Chr4:51790688`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B85
`Chr4:51790692`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A13,B15,B20,C79
`Chr4:51791611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C55
`Chr4:51791864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23
`Chr4:51793311`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:51795133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:51795139`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A18
`Chr4:51795139`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A18
`Chr4:51795142`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805193.1

880 aa

440

880

RRM_1

PF00076 RRM_1 391-458 aa PF00076 RRM_1 471-542 aa PF00076 RRM_1 569-633 aa

XP_057805194.1

858 aa

429

858

RRM_1

PF00076 RRM_1 391-458 aa PF00076 RRM_1 471-542 aa PF00076 RRM_1 569-633 aa

XP_057805195.1

828 aa

414

828

RRM_1

PF00076 RRM_1 391-458 aa PF00076 RRM_1 471-542 aa PF00076 RRM_1 569-633 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805193.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	391	458	3.1e-39	133.4	RNA recognition motif
`XP_057805193.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	471	542	3.1e-39	133.4	RNA recognition motif
`XP_057805193.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	569	633	3.1e-39	133.4	RNA recognition motif
`XP_057805194.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	391	458	2.8e-39	133.5	RNA recognition motif
`XP_057805194.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	471	542	2.8e-39	133.5	RNA recognition motif
`XP_057805194.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	569	633	2.8e-39	133.5	RNA recognition motif
`XP_057805195.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	391	458	2.4e-39	133.7	RNA recognition motif
`XP_057805195.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	471	542	2.4e-39	133.7	RNA recognition motif
`XP_057805195.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	569	633	2.4e-39	133.7	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100688.1
TTAGAAATTCTTGGCGTAAAAATTAACTCGTGAAATTTGATTTACGTATTAGTACTACCACTTCACGATCGGTCACCAGAGAACTAAAGATTGGTCGGCGGCGCCACCGCTCAATGCATCCTAAATCACCCATCGCCACCTCGTTGCCGCTCTACACGCCAATTTAATCCGATAATCGCAACCTCCATCCACCGACATTCCGACTTCCTCACAATCCTCCCGCGAAGCACATCCGTGAACGCGTCTAACACCATAAACAC...

XM_057949212.1
GACAAAAATGAAATCCCTTAAAAAAAAGATAAAGGGAACGACAATTAGAAATTCTTGGCGTAAAAATTAACTCGTGAAATTTGATTTACGTATTAGTACTACCACTTCACGATCGGTCACCAGAGAACTAAAGATTGGTCGGCGGCGCCACCGCTCAATGCATCCTAAATCACCCATCGCCACCTCGTTGCCGCTCTACACGCCAATTTAATCCGATAATCGCAACCTCCATCCACCGACATTCCGACTTCCTCACAATC...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC131020427
ATGGAGTCTGATATTGGTAGAGTCGACGGCAACAGTTTTGAGGAATCGGAAAATCGTTTTGATCTCGAGAACTCCGGTATTCAACACCGTGGGCCCGAAAAAATCGCTGACGTAGAAGCTGTTCGCGTTATTGAGGGTGGAGATGGAGGCAAAAATGCTGTTGTTTTATCTTGTGTTGGAGGAGAAAGGCCGCAGGTGGCAGATGGGGGCTCTGTGGAGCTCGTCATGGGGAACGAGAGCGCGACAGGTGGAGTGGCGGG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057805193.1
MESDIGRVDGNSFEESENRFDLENSGIQHRGPEKIADVEAVRVIEGGDGGKNAVVLSCVGGERPQVADGGSVELVMGNESATGGVAGTRSVKKKIVKKTVIVKRVIMKRVPKRVLINRTEDGINLSEVRINDTDPASDVIENSNVVDEVIEKAGRFNEAKSLNPVNYEDTVNTADGLTQSLKPVNYVDTVKEKPSIVCDVLKEEDIIAEVPQNLEMVNALNVSGPVVGEEVDDLSLEMELEMSKTGTNANVSEQMMPRNH...

XP_057805194.1
MESDIGRVDGNSFEESENRFDLENSGIQHRGPEKIADVEAVRVIEGGDGGKNAVVLSCVGGERPQVADGGSVELVMGNESATGGVAGTRSVKKKIVKKTVIVKRVIMKRVPKRVLINRTEDGINLSEVRINDTDPASDVIENSNVVDEVIEKAGRFNEAKSLNPVNYEDTVNTADGLTQSLKPVNYVDTVKEKPSIVCDVLKEEDIIAEVPQNLEMVNALNVSGPVVGEEVDDLSLEMELEMSKTGTNANVSEQMMPRNH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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