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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003550`

染色体: Chr04 坐标: 51859564-51863084 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003550`
名称	SmilChr04G003550
描述	probable glucan endo-1,3-beta-glucosidase BG3
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	51859564 - 51863084 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020434`
GeneID	`131020434`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020434`
原始查询	`SmilChr04G003550`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glucan endo-1,3-beta-glucosidase BG3
产物	probable glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase BG3
Arabidopsis	`AT3G57240` (BG3) beta-1,3-glucanase 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824891] identity=34.7; qcov=0.983; evalue=4.41e-51; confidence=low
Rice	`Os01g0940700` (OsPR2) - identity=34.3; qcov=0.993; evalue=6.02e-43; confidence=low
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00332 (Glyco_hydro_17)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020434

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057805205.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805205.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805205.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805205.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805205.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:51861597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr4:51861635`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A5,B2,B26,B29,B70,C21,C32,C35
`Chr4:51861656`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B12,B82
`Chr4:51861656`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B12,B82
`Chr4:51861670`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	4	B108,B24,B33,B37
`Chr4:51861670`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	4	B108,B24,B33,B37
`Chr4:51861685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,C46,C56
`Chr4:51861765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B43,C85
`Chr4:51861792`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr4:51861852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr4:51861969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B7,D4
`Chr4:51862018`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B53,C14,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805205.1

299 aa

150

299

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 1-188 aa PF00332 Glyco_hydro_17 244-289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805205.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	1	188	2.4e-43	149.6	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057805205.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	244	289	2.4e-43	149.6	Glycosyl hydrolases family 17

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949222.1
AAACAATACCTTCACGCCTCGCACACAGTAACACACACTGTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTCGCTGTCTCTGTCTCTCTCATCCAACCCGCGTACGAAAAAGTTACAAATAGAAAAGGAAAAAAAATCAAAAGAAGGAAGAAGTAGAGAGAGAAAGTAAAAGAAGGAAGACACAGAGTCAGAGAGAAGGGAGTCTTTTTTCTAGGGAAGGAAATCTTTCGTTCAATCTATTCCTCTCTCGTCTCCAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020434
ATGCGGCTATTCGACCCCCACGCTCCGACTCTCCGCGCCCTCAGCGGCACCAACATCCGCCTCATGATGGGCGTGTCGCACCCCGATCTCCGGGACCTCGCCAACTGCCCCCAGGCAGCCACTGCCTGGGTCAGCCGCAACATCCTACGCTTCCCCAACGTCACCTTCCGCTACATCATCGTCGGGAACGAGATCGAGCCGGAGTCGGAGCTGGGGCCCTTCGTGTTCCCGGCGATGCAGAACGTGTACCGCGCCATCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805205.1
MRLFDPHAPTLRALSGTNIRLMMGVSHPDLRDLANCPQAATAWVSRNILRFPNVTFRYIIVGNEIEPESELGPFVFPAMQNVYRAIRAAGLAASIQINLLTMWNPPQAAEFKCGVNWFIRPILEFIRDTSASIHLNVFPFYAYLNDRANINLSFALLQPNSGVVLGGVYYDNLFYAIHDAFVAAMGKILAAATPLSVQQLAIPENKGTKTTTSSGSSSGGGHNSPPPGSVPLGSGDEIMAVTDGPIATVDNARIYINNLM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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