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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003566`

染色体: Chr04 坐标: 52024493-52028914 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003566`
名称	SmilChr04G003566
描述	probable glutamate carboxypeptidase AMP1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52024493 - 52028914 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020446`
GeneID	`131020446`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020446`
原始查询	`SmilChr04G003566`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable glutamate carboxypeptidase AMP1
产物	probable glutamate carboxypeptidase AMP1
Arabidopsis	`AT3G54720` (AMP1) Peptidase M28 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824637] identity=56; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0790600` (GO) - identity=51.4; qcov=0.98; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004180 (carboxypeptidase activity)
KEGG	-
Pfam	PF04253 (TFR_dimer); PF04389 (Peptidase_M28)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020446

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057805231.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057805231.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057805231.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805231.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805231.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52024654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B113,B14,B44,B6,C67
`Chr4:52024661`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr4:52024716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B56,B96
`Chr4:52024943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C56,C71,C86
`Chr4:52025007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:52025036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C3
`Chr4:52025905`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr4:52026828`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,C56,C71,C86
`Chr4:52026990`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:52027930`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B64,B93
`Chr4:52028046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:52028574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B30,B72

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805231.1

684 aa

342

684

Peptidase_M28

TFR_dimer

PF04389 Peptidase_M28 310-498 aa PF04253 TFR_dimer 557-679 aa

XP_057805232.1

683 aa

342

683

Peptidase_M28

TFR_dimer

PF04389 Peptidase_M28 310-497 aa PF04253 TFR_dimer 556-678 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805231.1`	Pfam	`PF04389`	Peptidase_M28	Domain	310	498	3.7e-24	86.2	Peptidase family M28
`XP_057805231.1`	Pfam	`PF04253`	TFR_dimer	Domain	557	679	4.7e-31	108.0	Transferrin receptor-like dimerisation domain
`XP_057805232.1`	Pfam	`PF04389`	Peptidase_M28	Domain	310	497	3.6e-24	86.3	Peptidase family M28
`XP_057805232.1`	Pfam	`PF04253`	TFR_dimer	Domain	556	678	5.1e-31	107.9	Transferrin receptor-like dimerisation domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949249.1
TAGCAGGTTTCAGTGTAAAACTAGAGTGTTGAATGAATTAATTGGTTTCAATGTACGAAGTGGCAGAGTTCATCACTGCACACTGAAAACCTCTCCGTAGAGAATTTCTGAAGCTTTTTCCAAAAATGGCGTTTTCCTGTAAAACACCAAAATGCACTCTCCTCTTCCTCTTCACTCTCTCTCTCCTCGCCCTCTACACCCTCCACCACCACCCTCTTCTCCCCTCCCCCTCCTCTCTCACCGCCGCCAACGTATTCCTC...

XM_057949248.1
TAGCAGGTTTCAGTGTAAAACTAGAGTGTTGAATGAATTAATTGGTTTCAATGTACGAAGTGGCAGAGTTCATCACTGCACACTGAAAACCTCTCCGTAGAGAATTTCTGAAGCTTTTTCCAAAAATGGCGTTTTCCTGTAAAACACCAAAATGCACTCTCCTCTTCCTCTTCACTCTCTCTCTCCTCGCCCTCTACACCCTCCACCACCACCCTCTTCTCCCCTCCCCCTCCTCTCTCACCGCCGCCAACGTATTCCTC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020446
ATGGCGTTTTCCTGTAAAACACCAAAATGCACTCTCCTCTTCCTCTTCACTCTCTCTCTCCTCGCCCTCTACACCCTCCACCACCACCCTCTTCTCCCCTCCCCCTCCTCTCTCACCGCCGCCAACGTATTCCTCTCCTCTGCCAGCAACTACACCGTCTCCGCCTACCTCCGCCACCTGACCCTCCGCCCCCACCTCGCCGGCACCCCTCTCTCCCTCTCCACCGCCCTCTACGTCCACTCCCACTTCCAATCCCTCGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805231.1
MAFSCKTPKCTLLFLFTLSLLALYTLHHHPLLPSPSSLTAANVFLSSASNYTVSAYLRHLTLRPHLAGTPLSLSTALYVHSHFQSLGLTAHTTNFSALLSYPAHSSLSAHFSNGTVLPVPLPEPGVSGSGVVPPYHAYSPSGAAYGPAVFLNYGRNLDYRALAAQGVEVKGCVGLVRRGCGVSRHEAAANAAAHGVAALLMYTEGEYREGVERGTVMKGVGDPLTPGWAGGEKLDPDDPRVARRFPTVPSLPVSQAAAER...

XP_057805232.1
MAFSCKTPKCTLLFLFTLSLLALYTLHHHPLLPSPSSLTAANVFLSSASNYTVSAYLRHLTLRPHLAGTPLSLSTALYVHSHFQSLGLTAHTTNFSALLSYPAHSSLSAHFSNGTVLPVPLPEPGVSGSGVVPPYHAYSPSGAAYGPAVFLNYGRNLDYRALAAQGVEVKGCVGLVRRGCGVSRHEAAANAAAHGVAALLMYTEGEYREGVERGTVMKGVGDPLTPGWAGGEKLDPDDPRVARRFPTVPSLPVSQAAAER...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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