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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003567`

染色体: Chr04 坐标: 52049419-52053391 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003567`
名称	SmilChr04G003567
描述	probable E3 ubiquitin-protein ligase BAH1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52049419 - 52053391 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020447`
GeneID	`131020447`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020447`
原始查询	`SmilChr04G003567`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable E3 ubiquitin-protein ligase BAH1-like
产物	probable E3 ubiquitin-protein ligase BAH1-like
Arabidopsis	`AT2G38920` (AT2G38920) SPX (SYG1/Pho81/XPR1) domain-containing protein / zinc finger (C3HC4-type RING finger) protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818477] identity=57.2; qcov=0.988; evalue=1.43e-120; confidence=high
Rice	`Os03g0650900` (OsNLA2) - identity=55; qcov=1.01; evalue=3.92e-127; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF13445 (zf-RING_UBOX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020447

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057805233.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057805233.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057805233.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805233.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805233.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52049821`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr4:52051916`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:52052277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr4:52052897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B85
`Chr4:52053037`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A6,B1,B108,B25,B45,B52,B97,C15,C20,C51

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805233.1

336 aa

168

336

zf-RING_UBOX

zf-C3HC4

PF13445 zf-RING_UBOX 232-278 aa PF00097 zf-C3HC4 232-280 aa

XP_057805234.1

336 aa

168

336

zf-RING_UBOX

zf-C3HC4

PF13445 zf-RING_UBOX 232-278 aa PF00097 zf-C3HC4 232-280 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805233.1`	Pfam	`PF13445`	zf-RING_UBOX	Domain	232	278	6.9e-08	33.1	RING-type zinc-finger
`XP_057805233.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	232	280	5.5e-06	26.9	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057805234.1`	Pfam	`PF13445`	zf-RING_UBOX	Domain	232	278	6.8e-08	33.1	RING-type zinc-finger
`XP_057805234.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	232	280	5.5e-06	26.9	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949251.1
TAAATTTCGTAAATGGAAAATAAAATAGTGAAAAATGGCAACAAGTGCAATGCATGCAGTGGTTAGCGATAGGGATTGTTGCTGCCTACGAAAAACGCGGACGTATAAATCTGCGCCGCTGCCGCTTCTGTTGCTACTTTTTCTTCTTCTTCTTCAATCATCTCCACCGTCTTCTCTCCATTTAATTTAACTAAGGCTCCCTTTCCGATTTATGGGCGTGGGCGTCACAGATTTTCAATTTTCTTGAGCCGCGAATACTT...

XM_057949250.1
TTCGTAAATGGAAAATAAAATAGTGAAAAATGGCAACAAGTGCAATGCATGCAGTGGTTAGCGATAGGGATTGTTGCTGCCTACGAAAAACGCGGACGTATAAATCTGCGCCGCTGCCGCTTCTGTTGCTACTTTTTCTTCTTCTTCTTCAATCATCTCCACCGTCTTCTCTCCATTTAATTTAACTAAGGCTCCCTTTCCGATTTATGGGCGTGGGCGTCACAGATTTTCAATTTTCTTGAGCCGCGAATACTTGAAAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020447
ATGAAGTTTGGGGAGAAGTTTTCCGAGTATCTGGAAACGAATCAAGAGAGGTTCGTGGAGAATTGCCGCCATGTTGAGTACAAGCGCCTTAAGAAGGTGCTGAAGAGATGCAGACGTTGTAGGGCTATCAACGATTCCCCGTCTTCAACTGCCGTGGATGATAATGGAGATGAAGCTGCATTCTCTCAGTTTTGCCAATTTGAGTCTTGCCAATTGTGTGATCAGAAATTCTTCTCTGAGCTGATGAAGGAGGCTATTGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805233.1
MKFGEKFSEYLETNQERFVENCRHVEYKRLKKVLKRCRRCRAINDSPSSTAVDDNGDEAAFSQFCQFESCQLCDQKFFSELMKEAIDIGGCFSSRVRQLLQFHIHGGAQRYFTFLRYCFVSPQQKTAQECRMLTEYVMMNAVAMRKILKKYDKIHSSANGSKFKSKMRAEHMEILQSPWLIELGAFCKNFNQPRCENSSVLENPFSFDLTASGPTMTLILPDSIKLEYDLTCAICLDLVFNPYALGCGHLFCKSCACSAA...

XP_057805234.1
MKFGEKFSEYLETNQERFVENCRHVEYKRLKKVLKRCRRCRAINDSPSSTAVDDNGDEAAFSQFCQFESCQLCDQKFFSELMKEAIDIGGCFSSRVRQLLQFHIHGGAQRYFTFLRYCFVSPQQKTAQECRMLTEYVMMNAVAMRKILKKYDKIHSSANGSKFKSKMRAEHMEILQSPWLIELGAFCKNFNQPRCENSSVLENPFSFDLTASGPTMTLILPDSIKLEYDLTCAICLDLVFNPYALGCGHLFCKSCACSAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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