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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003571`

染色体: Chr04 坐标: 52130561-52139241 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003571`
名称	SmilChr04G003571
描述	uncharacterized SmilChr04G003571
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52130561 - 52139241 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023596`
GeneID	`131023596`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023596`
原始查询	`SmilChr04G003571`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=33.7; qcov=1; evalue=2.55e-112; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13963 (Transpos_assoc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023596

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809122.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057809122.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057809122.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809122.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809122.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52130587`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:52130595`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B41,B85,D11
`Chr4:52130596`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A2,C58
`Chr4:52130596`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A2,C58
`Chr4:52136688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,B98
`Chr4:52136691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,B98
`Chr4:52136756`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69
`Chr4:52136758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr4:52136785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr4:52136817`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,B98
`Chr4:52136825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B69
`Chr4:52136825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809122.1

656 aa

328

656

Transpos_assoc

Transposase_21

PF13963 Transpos_assoc 5-81 aa PF02992 Transposase_21 291-503 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809122.1`	Pfam	`PF13963`	Transpos_assoc	Domain	5	81	1.6e-18	67.3	Transposase-associated domain
`XP_057809122.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	291	503	2e-79	266.5	Transposase family tnp2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953139.1
CGAAATTACCGGCCAGTTACCGACGGCAAACTCGCCGCCGGTATGTAACGGCGGCGTCGCCGTCGTTAATGTTAAAATACGCATTATTTAATTAAATTTATAGACTTAGCGGCGGCAAAATCCCCGCCGCTATATAGCGGCGGCATTTGCCGTCGGTAACCTTTAAAATATAGGGCAGCGGGTTTGCCCATTTTTTCAGTATCTGCGCCGCAACCAACCCCCCCACGCGAACAGAAACTACCCCCCCAGCCCCTCCCCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023596
ATGAGTGATAATCGTACGTGGATGTACGCGAGATACAATGATCGTACCGCATTTGAAACGGGGCTTGAGTTTTTCCTTGAGTGGGCGTTCAATCAAACGGCGTACACAGATGGACAAGGTAACATTAGGTGCCCGTGTAAGAAGTGCAAGAATCAAGCGTATTTAGATGTACCTATGGTCAGAGAACATGTTAGTAGGCGTGGATTTGTCCTGAATTACAAAGTTTGGGTTTGTCACGGGGAAGCACCGCTGTCTATGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809122.1
MSDNRTWMYARYNDRTAFETGLEFFLEWAFNQTAYTDGQGNIRCPCKKCKNQAYLDVPMVREHVSRRGFVLNYKVWVCHGEAPLSMPREHAIMNEDDGLYNNYERMVHDHAGPSNYQDPPNLEQPPNNDAQQIYNMLDAADTPLYAGCDTYSQLSWMTQFMSIKTESHMSERTYNQMSSMMKAALPEGNNCPEDFYSTKRNLRGLGLPVEKIDCCVNNCMLYWGETSELHSCMFCDQSRYKDSLRASGSRRKKQVPAKQM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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