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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003576`

染色体: Chr04 坐标: 52165337-52169803 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003576`
名称	SmilChr04G003576
描述	uncharacterized SmilChr04G003576
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52165337 - 52169803 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020454`
GeneID	`131020454`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020454`
原始查询	`SmilChr04G003576`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820349]; symbol=AT3G11760; hit=AT3G11760; species=arabidopsis; confidence=high
产物	structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820349]; symbol=AT3G11760; hit=AT3G11760; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G11760` (AT3G11760) structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820349] identity=54.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0649000` - identity=51.2; qcov=1.05; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10358 (NT-C2); PF28979 (DUF8490)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020454

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057805240.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057805240.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057805240.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805240.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805240.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52165740`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:52165790`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C40
`Chr4:52165942`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B28,B76,C16
`Chr4:52166078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B81,C84
`Chr4:52166105`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B64,B93,B99
`Chr4:52166180`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:52166210`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94
`Chr4:52166231`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B82,D11
`Chr4:52166255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:52166357`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B107,B22
`Chr4:52166557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr4:52167172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805240.1

758 aa

379

758

NT-C2

DUF8490

PF10358 NT-C2 87-156 aa PF28979 DUF8490 429-734 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805240.1`	Pfam	`PF10358`	NT-C2	Domain	87	156	3.1e-09	37.4	N-terminal C2 in EEIG1 and EHBP1 proteins
`XP_057805240.1`	Pfam	`PF28979`	DUF8490	Domain	429	734	1.1e-136	455.1	Domain of unknown function (DUF8490)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949257.1
AACGCACATTGCACATAGACTCTACGCGCACAGAGTCCCACAGAATACCAACTTCTACGCACAAAAACATCTCTCTACAGTCTACATACGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGCTGGTCTCTACAGGCACGCTGCTGTTATTACTAGTATCTTTGAAGGCCAGCAAAATAACGGCATATTCCCCTCTTCCTCTCACACACTTTTTAGAGAGAGAAATCCTCAAATTGAAAAAAGGCATTATTTTGTATATCTGCATTTGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020454
ATGGTGGTGAAGATAATGAGGTGGAGGCCATGGCCGCCTCTTGTTTCGAAGAAATACGAGATGAGGCTCAACGTGAAGAGGCTCGAGTGCGGGGATTGGGTGCATGAGGGCGCAGATAAGGATAATGGTGGACTCGCCGTTGAGATCAGGTGGAAGGGCCACAAGATTTCGCTGGGTTCTTTCCGGAGGAGCGTGCGGAGGAACTGTACTAGGGAACAGATGCTCAAGAGGGTCGATGGGCCCAACGGCGCCGTTTTGGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805240.1
MVVKIMRWRPWPPLVSKKYEMRLNVKRLECGDWVHEGADKDNGGLAVEIRWKGHKISLGSFRRSVRRNCTREQMLKRVDGPNGAVLVEWDEDFHTVCTLSRHKENVFHPWEISFNVLHGLSQGTKNKISIVGSASLNLAEYASKTEEHVEVKIPLAVSGIVVECRPMLCLSFSLLELIDVQEAAAVVQSPVISLPSPSAPGETCATEKDEVSALKAGLRKVKIFTEYVSTHRAKKACREEEGSEERSSAKSEEGEYSYSF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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