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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003583`

染色体: Chr04 坐标: 52256056-52259495 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003583`
名称	SmilChr04G003583
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 15
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52256056 - 52259495 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020461`
GeneID	`131020461`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020461`
原始查询	`SmilChr04G003583`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 15
产物	fasciclin-like arabinogalactan protein 15
Arabidopsis	`AT5G06390` (FLA17) FASCICLIN-like arabinogalactan protein 17 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830527] identity=71.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0788600` (OsFLA24) - identity=71.6; qcov=0.952; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02469 (Fasciclin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020461

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057805258.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057805258.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805258.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805258.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805258.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52257956`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:52257960`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A21,B93,B99,C23
`Chr4:52257967`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B13,B80,B99
`Chr4:52258038`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr4:52258281`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:52258328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B131,C32,C68
`Chr4:52258395`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:52258419`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:52258488`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A21,B84,B93,B99,C23
`Chr4:52258682`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr4:52258730`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B125,B90,B92,C87
`Chr4:52258748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805258.1

459 aa

230

459

Fasciclin

PF02469 Fasciclin 51-187 aa PF02469 Fasciclin 304-414 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805258.1`	Pfam	`PF02469`	Fasciclin	Domain	51	187	2.8e-28	99.3	Fasciclin domain
`XP_057805258.1`	Pfam	`PF02469`	Fasciclin	Domain	304	414	2.8e-28	99.3	Fasciclin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100708.1
GGAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAGAAAAGCATATGATATAACACGACATCGCCCCTACTAGTATTTCCGAACTCTTTCTTTCTTCCTACTTTAATACTCCACCAAACAACATAGCCCTATTCTATTAACCCCCTTCCAAACCAACTCCACATTTTTTCTCTCACTCCATTTCTCCCATTAGAGAAAGAAAGTAACACACACACACACCCACTAACTTACATATTACTCTAGAGTGAGAAACCCCCAAATTCATCAATCGT...

XM_057949275.1
TCTTTCTTTCTTCCTACTTTAATACTCCACCAAACAACATAGCCCTATTCTATTAACCCCCTTCCAAACCAACTCCACATTTTTTCTCTCACTCCATTTCTCCCATTAGAGAAAGAAAGTAACACACACACACACCCACTAACTTACATATTACTCTAGAGTGAGAAACCCCCAAATTCATCAATCGTCATGGATTCTCAGATCTATGGCGCCCCTAATCTCCTCTCTCTCGCCTTCCTCGCTCTCCTCGCCATCACCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020461
ATGGATTCTCAGATCTATGGCGCCCCTAATCTCCTCTCTCTCGCCTTCCTCGCTCTCCTCGCCATCACCGCCTCGGCATTGCCGGCGAAACCAGCCAACTCCGCCGGCCAAATCAATTCCAATTCAGTCCTCGTAGCTCTCCTCGATTCCCATTACACCGAGCTGTCGGAGCTGGTGGAGAAGGCTCTGCTGCTGCAAACGCTCGAAGATGCCGTCACCAACCACAACATTTCCATATTCGCCCCCAGGAATGAGGCGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805258.1
MDSQIYGAPNLLSLAFLALLAITASALPAKPANSAGQINSNSVLVALLDSHYTELSELVEKALLLQTLEDAVTNHNISIFAPRNEALERDLDPEFKRFLLEPGNLKSLQNLLLFHMIPTRIQSNHWPVGPGKKPVLHTSLCRDAAAEMIPLHEKNGQKIVGTARVIKSDDIVRPDGIIHGIERLLVPKSVQQEFNARRSLRATSAVIPEGAPEVDPRTHRLKKSAPAVPAGAPPALPVYDALAPGPSLAPAPAPGPGGPH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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