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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003592`

染色体: Chr04 坐标: 52353605-52356162 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003592`
名称	SmilChr04G003592
描述	arginine-specific demethylase JMJ22
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52353605 - 52356162 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020471`
GeneID	`131020471`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020471`
原始查询	`SmilChr04G003592`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	arginine-specific demethylase JMJ22
产物	arginine-specific demethylase JMJ22
Arabidopsis	`AT5G06550` (AT5G06550) transferring glycosyl group transferase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830543] identity=69.7; qcov=0.939; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0572800` (JMJ710) - identity=62.3; qcov=0.916; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000987 (cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0043985 (GO:0043985)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF02373 (JmjC); PF12937 (F-box-like); PF13621 (Cupin_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020471

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805276.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805276.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805276.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805276.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805276.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52354758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,C32,C68
`Chr4:52354911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B4,C19,C36,C71
`Chr4:52355200`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A25,B36
`Chr4:52355235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B44
`Chr4:52355517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B67,C39
`Chr4:52355625`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B95,C43
`Chr4:52355625`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B95,C43
`Chr4:52355766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C7
`Chr4:52355879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B2,B67,C39
`Chr4:52356003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C45,C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805276.1

512 aa

256

512

F-box

F-box-like

Cupin_8

JmjC

PF00646 F-box 99-138 aa PF12937 F-box-like 102-142 aa PF13621 Cupin_8 215-434 aa PF02373 JmjC 322-433 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805276.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	99	138	4.2e-06	27.2	F-box domain
`XP_057805276.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	102	142	1.6e-07	31.7	F-box-like
`XP_057805276.1`	Pfam	`PF13621`	Cupin_8	Domain	215	434	4.9e-24	86.3	Cupin-like domain
`XP_057805276.1`	Pfam	`PF02373`	JmjC	Domain	322	433	2.4e-13	51.3	JmjC domain, hydroxylase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949293.1
TACAGTACGTTTGTTTAACCTCTACTGACGTGGGATTAGTACTAGTGTAAAATCCTTTTAAGGGTTGGTTGCGTTTCCTCCCTCCGCCTCCAGCCCAGCAAATACTCTCCGGCGGTTTCAACCGCCGCCGACGCTGCCGTTGTTCAAAATGCTTAGCTCCAAAAATCTATGGCTCAAGTCTAGATCGAAGAAATCGAAACAATCCCGTCTAACCCATTCCAAGAGGCCGAACTCAATCAGAAAGAAACCAAAACTTGAAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020471
ATGCTTAGCTCCAAAAATCTATGGCTCAAGTCTAGATCGAAGAAATCGAAACAATCCCGTCTAACCCATTCCAAGAGGCCGAACTCAATCAGAAAGAAACCAAAACTTGAATTAAAAAATCAAGCAACAGCCTTGGCACCAACAGAAGACGAAGAATACGAGCAAACTGAAGAAGGTATATTCAGCTTGAAAAACTCGGCTCAATCCCACTCACACGGCGTCCAACCATTGGGTAATCTCTACTTCAGCTCCTCGTCCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805276.1
MLSSKNLWLKSRSKKSKQSRLTHSKRPNSIRKKPKLELKNQATALAPTEDEEYEQTEEGIFSLKNSAQSHSHGVQPLGNLYFSSSSINSRNTGLGNLQILTDELVLEILAFLSGAQLGVLSTVSKSFYVFCNQEPLWRNLVLDTCQNGFLYNGTWKNTFVSAYRCSFMIVSSGVRIRDFYSDYLFQSWLCANLEMKSEWLERDNIVRRRGISVDEFISSFEEPNKPVLLEGCLGKWPAMKKWDREYLVEVCGDTEFSVGP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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