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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003612`

染色体: Chr04 坐标: 52606022-52615304 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003612`
名称	SmilChr04G003612
描述	uncharacterized SmilChr04G003612
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52606022 - 52615304 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020486`
GeneID	`131020486`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020486`
原始查询	`SmilChr04G003612`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817096]; symbol=AT2G25570; hit=AT2G25570; species=arabidopsis; confidence=high
产物	binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817096]; symbol=AT2G25570; hit=AT2G25570; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G25570` (AT2G25570) binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817096] identity=68.3; qcov=0.896; evalue=1.58e-125; confidence=high
Rice	`Os02g0202600` - identity=66.3; qcov=0.896; evalue=8.73e-119; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF08238 (Sel1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020486

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057805315.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057805315.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805315.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805315.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805315.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52606247`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C57
`Chr4:52606367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B37,B5,C62
`Chr4:52614780`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr4:52614915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B127,B37,B5,C62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805315.1

278 aa

139

278

Sel1

PF08238 Sel1 123-156 aa PF08238 Sel1 161-194 aa

XP_057805316.1

278 aa

139

278

Sel1

PF08238 Sel1 123-156 aa PF08238 Sel1 161-194 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805315.1`	Pfam	`PF08238`	Sel1	Repeat	123	156	1.2e-09	39.1	Sel1 repeat
`XP_057805315.1`	Pfam	`PF08238`	Sel1	Repeat	161	194	1.2e-09	39.1	Sel1 repeat
`XP_057805316.1`	Pfam	`PF08238`	Sel1	Repeat	123	156	1.2e-09	39.1	Sel1 repeat
`XP_057805316.1`	Pfam	`PF08238`	Sel1	Repeat	161	194	1.2e-09	39.1	Sel1 repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949332.1
CAGTTACGCGCCACCAATTTGACTTTTGAGGCGTATCGAAATTAGCTCTTTTGGGAAACCTCAATTAATATCTCACGCTCGCCGCCGTCTCAGCCGTGTCCCCTCCCCGGCAGCCGCAGCCGTTGTCCAGCCCTAATTTCTACGAGAAGTCTTGAAATTCTCACATCTGGTTCTGCAATAGGTGAAAAATGTTCAAAGCATTCCGTTGGAAGCCTTCTTATAGGCAACTCTCTGCAGTTGTTGTTTCTCCCCAATTCAAT...

XM_057949333.1
GACTTTTGAGGCGTATCGAAATTAGCTCTTTTGGGAAACCTCAATTAATATCTCACGCTCGCCGCCGTCTCAGCCGTGTCCCCTCCCCGGCAGCCGCAGCCGTTGTCCAGCCCTAATTTCTACGAGAAGTCTTGAAATTGTGAAAAATGTTCAAAGCATTCCGTTGGAAGCCTTCTTATAGGCAACTCTCTGCAGTTGTTGTTTCTCCCCAATTCAATTTGTGGAGAGGAATGCATAGTAGGTCTAAGAAGGCAATGGAG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020486
ATGTTCAAAGCATTCCGTTGGAAGCCTTCTTATAGGCAACTCTCTGCAGTTGTTGTTTCTCCCCAATTCAATTTGTGGAGAGGAATGCATAGTAGGTCTAAGAAGGCAATGGAGTTCGTAGCCAAAGGATTTAGTGCTTTGCAGGAAGTTGACAGAGTTATTGATTATTGTGAGCGTAATGATCAGCGTCTCATCCCTTTGCTTAGGGCAGCAAAGCAACATTTTGAGTTGGCTCTTGAAGCTGACAACTCGAGCACTAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805315.1
MFKAFRWKPSYRQLSAVVVSPQFNLWRGMHSRSKKAMEFVAKGFSALQEVDRVIDYCERNDQRLIPLLRAAKQHFELALEADNSSTNARYWLAKVHLKYQFCPGACKPVGAALLVEAAEMGNPNAQYDLACHLRAEDRLAQSAQKAMYYLQKAVDQLHPGALYLLGAIYLTGDCVNQDISSAIWCFHRAAEKGHAGAAIAYGSLLLAGVRLPESVTKFNVKKASSIRKQRDDSGSDEYNPVEMARDQFEIAANAGCDLGL...

XP_057805316.1
MFKAFRWKPSYRQLSAVVVSPQFNLWRGMHSRSKKAMEFVAKGFSALQEVDRVIDYCERNDQRLIPLLRAAKQHFELALEADNSSTNARYWLAKVHLKYQFCPGACKPVGAALLVEAAEMGNPNAQYDLACHLRAEDRLAQSAQKAMYYLQKAVDQLHPGALYLLGAIYLTGDCVNQDISSAIWCFHRAAEKGHAGAAIAYGSLLLAGVRLPESVTKFNVKKASSIRKQRDDSGSDEYNPVEMARDQFEIAANAGCDLGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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