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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003618`

染色体: Chr04 坐标: 52685126-52688951 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003618`
名称	SmilChr04G003618
描述	putative HVA22-like protein g
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52685126 - 52688951 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020492`
GeneID	`131020492`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020492`
原始查询	`SmilChr04G003618`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative HVA22-like protein g
产物	putative HVA22-like protein g
Arabidopsis	`AT2G36020` (HVA22J) HVA22-like protein J [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818175] identity=43.6; qcov=0.722; evalue=9.42e-56; confidence=medium
Rice	`Os03g0250200` - identity=45.1; qcov=0.573; evalue=6.36e-47; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03134 (TB2_DP1_HVA22)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020492

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057805326.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057805326.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.60000	`XP_057805326.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805326.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805326.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52686199`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B99
`Chr4:52686311`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B4,B93,C71,D7
`Chr4:52687632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,B26
`Chr4:52687925`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805326.1

248 aa

124

248

TB2_DP1_HVA22

PF03134 TB2_DP1_HVA22 19-97 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805326.1`	Pfam	`PF03134`	TB2_DP1_HVA22	Family	19	97	1.3e-23	83.4	TB2/DP1, HVA22 family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949343.1
GGAGGAATCCCAAGAAATCCACCAGACTGCCTCCCTTCATTCTCTCTCTCTCCCCTCCAACTTTCAATCTTCTTCACTCTTTTATTATTGAACCCCATTTTCTCTCTCCACACACACAACTATATATACACACCATAATACTTACTCTGATGCACGTTCATTCAAATTGTCTTCCTCTCTCCCTGCCGTCTCTGGTTTCTGAGATTTCATTTTATTTCTCAGGAACCCATTTCATTCTCGCACTAGAGATATTGACAGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020492
ATGATTGAGGAATTAATTACCAGGACCTTGATATTGGTCTTTGGATATGCATATCCTGCATTCCAATGTTTCAAAACTATAGAGAAAAATAAAGTTACGGTCCCAGAACTCAGGTTTTGGTGCCAATATTGGGTGATTGTGGCGTTGATATCAATTCTGGAAAAAGTTCTTGATATATTTATTTCATGGGTGCCTTTCTACCGAGGGATAAAGTTAATCCTGTACATTTACTTGTGGCATCCCGGTACAAAGGGGAGTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805326.1
MIEELITRTLILVFGYAYPAFQCFKTIEKNKVTVPELRFWCQYWVIVALISILEKVLDIFISWVPFYRGIKLILYIYLWHPGTKGSTYMYDTAVQPYVSRHEATIDRGIAELKERAWNLALSYWYNCADMSSKKVLQCLQLLMTQVMNAALSRPQSQEAQSNDTSTPTPPSTPSGIFKRNVSEKRRPPVVPPGTVGSPTPKSDTTKVKLHNQAQFIHNDEAPTKQEKSENDQDFLAAKVKLRRVSNKE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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