当前解析结果
SmilChr04G003625| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003625 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003625 |
| 描述 | ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1D-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 52738515 - 52741638 / + |
| NCBI Gene ID | LOC131020498 |
|---|---|
| GeneID | 131020498 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020498 |
| 原始查询 | SmilChr04G003625 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1D-like |
| 产物 | ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1D-like |
| Arabidopsis | AT3G52560 (UEV1D-4)ubiquitin E2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824422] identity=92.5; qcov=1; evalue=2.28e-102; confidence=high |
| Rice | Os09g0297100 (MMS2)- identity=89.9; qcov=1.01; evalue=1.08e-99; confidence=high |
| GO | GO:0005634 (nucleus); GO:0006301 (DNA damage tolerance); GO:0070534 (protein K63-linked ubiquitination) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00179 (UQ_con) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020498 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057805333.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057805333.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.60000 | XP_057805333.1 |
| 4 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.60000 | XP_057805333.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057805333.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057805333.1PF00179
UQ_con 44-136 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057805333.1 |
Pfam | PF00179 |
UQ_con | Domain | 44 | 136 | 2e-14 | 54.1 | Ubiquitin-conjugating enzyme |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。