当前解析结果
SmilChr04G003633| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003633 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003633 |
| 描述 | ACT domain-containing protein ACR10-like |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 52834489 - 52837820 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020507 |
|---|---|
| GeneID | 131020507 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020507 |
| 原始查询 | SmilChr04G003633 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | ACT domain-containing protein ACR10-like |
| 产物 | ACT domain-containing protein ACR10-like |
| Arabidopsis | AT2G36840 (ACR10)ACT-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818257] identity=57.2; qcov=1.01; evalue=2.22e-167; confidence=high |
| Rice | Os09g0570900 (B1331F11.3-1)- identity=55.2; qcov=1.01; evalue=5.88e-163; confidence=high |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF01842 (ACT); PF24914 (ACR10_N); PF24926 (ACT_ACR9_C); PF24931 (ACT_ACR9_3rd) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020507 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057805339.1 |
| 2 | Cytosol | 细胞质基质 | 1.00000 | XP_057805339.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057805339.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057805339.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057805339.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:52836284 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C43 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057805339.1PF24914
ACR10_N 11-86 aa
PF01842
ACT 111-170 aa
PF24931
ACT_ACR9_3rd 234-332 aa
PF24926
ACT_ACR9_C 333-409 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057805339.1 |
Pfam | PF24914 |
ACR10_N | Domain | 11 | 86 | 2.8e-44 | 149.1 | ACT domain-containing protein ACR10, N-terminal |
XP_057805339.1 |
Pfam | PF01842 |
ACT | Domain | 111 | 170 | 3.4e-12 | 46.6 | ACT domain |
XP_057805339.1 |
Pfam | PF24931 |
ACT_ACR9_3rd | Domain | 234 | 332 | 3.8e-52 | 175.1 | ACR9-like, ACT-like domain |
XP_057805339.1 |
Pfam | PF24926 |
ACT_ACR9_C | Domain | 333 | 409 | 3.6e-38 | 130.1 | ACT domain-containing protein ACR9, C-terminal |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。