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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003647`

染色体: Chr04 坐标: 52975421-52977408 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003647`
名称	SmilChr04G003647
描述	thylakoid lumenal 15.0 kDa protein 2, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	52975421 - 52977408 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020518`
GeneID	`131020518`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020518`
原始查询	`SmilChr04G003647`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thylakoid lumenal 15.0 kDa protein 2, chloroplastic
产物	thylakoid lumenal 15.0 kDa protein 2%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT5G52970` (AT5G52970) thylakoid lumen 15.0 kDa protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835375] identity=78.5; qcov=0.846; evalue=6.45e-105; confidence=high
Rice	`Os07g0534000` - identity=68.6; qcov=0.551; evalue=2.48e-55; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04536 (TPM_phosphatase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020518

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057805357.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.80000	`XP_057805358.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057805357.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805357.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805357.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:52975715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B68
`Chr4:52975759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr4:52975764`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr4:52975795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B68
`Chr4:52975934`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B23,B68
`Chr4:52976233`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B32,B59,B86
`Chr4:52976278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B58
`Chr4:52977152`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B30
`Chr4:52977152`	`GGA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B30
`Chr4:52977287`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805357.1

219 aa

110

219

TPM_phosphatase

PF04536 TPM_phosphatase 83-172 aa

XP_057805358.1

214 aa

107

214

TPM_phosphatase

PF04536 TPM_phosphatase 83-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805357.1`	Pfam	`PF04536`	TPM_phosphatase	Domain	83	172	7.1e-07	29.9	TPM domain
`XP_057805358.1`	Pfam	`PF04536`	TPM_phosphatase	Domain	83	198	1.1e-07	32.5	TPM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949375.1
TGATAATTTTCGTTATTATTTGGACATATTATCTTCAACACAAAACAAACATCCAATTCTAAATTCTCCACCATCTCCAAATGGCGTTTCGTATGCAGCTATCATCCTCATCTCTCAAGCTCCCCCACAAAAATCATCTCCCTCTCTTCACAAATCCTTCACTTTCCCCGCAGCCACCTTCATGGCCTTCTTCCCTTCGCTCCAATTCTTGGAACTTCTTCATGTCCGGCACTCTCTCTCTTGCTCTCTCTCTCTCCGGA...

XM_057949374.1
TTATTTGGACATATTATCTTCAACACAAAACAAACATCCAATTCTAAATTCTCCACCATCTCCAAATGGCGTTTCGTATGCAGCTATCATCCTCATCTCTCAAGCTCCCCCACAAAAATCATCTCCCTCTCTTCACAAATCCTTCACTTTCCCCGCAGCCACCTTCATGGCCTTCTTCCCTTCGCTCCAATTCTTGGAACTTCTTCATGTCCGGCACTCTCTCTCTTGCTCTCTCTCTCTCCGGAGTAGGATGTGCTGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020518
ATGGCGTTTCGTATGCAGCTATCATCCTCATCTCTCAAGCTCCCCCACAAAAATCATCTCCCTCTCTTCACAAATCCTTCACTTTCCCCGCAGCCACCTTCATGGCCTTCTTCCCTTCGCTCCAATTCTTGGAACTTCTTCATGTCCGGCACTCTCTCTCTTGCTCTCTCTCTCTCCGGAGTAGGATGTGCTGAAGGAAAAGTAGGGGTGAACAAGCCAGAATTACTACCTAAAGATTTCACTACTGTAATTGATGTTGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805357.1
MAFRMQLSSSSLKLPHKNHLPLFTNPSLSPQPPSWPSSLRSNSWNFFMSGTLSLALSLSGVGCAEGKVGVNKPELLPKDFTTVIDVAGFLSDGQEKRISQEIAALEKDTGYKLRVLAQNYPDTPGLAIKDFWKVDDNTIVFVADPTFGNILNFNVGASIDLDVPRSFWSRLAGKYGNMFYWKEKVRFLRPILCPTTHFQYLREFILIRSLYLEGRRYCY

XP_057805358.1
MAFRMQLSSSSLKLPHKNHLPLFTNPSLSPQPPSWPSSLRSNSWNFFMSGTLSLALSLSGVGCAEGKVGVNKPELLPKDFTTVIDVAGFLSDGQEKRISQEIAALEKDTGYKLRVLAQNYPDTPGLAIKDFWKVDDNTIVFVADPTFGNILNFNVGASIDLDVPRSFWSRLAGKYGNMFYWKEKGEDTAIESAVMAISTCLREPAGANSCSEVN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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