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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003652`

染色体: Chr04 坐标: 53005444-53010058 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003652`
名称	SmilChr04G003652
描述	ribosome biogenesis regulatory protein homolog
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53005444 - 53010058 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020525`
GeneID	`131020525`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020525`
原始查询	`SmilChr04G003652`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ribosome biogenesis regulatory protein homolog
产物	ribosome biogenesis regulatory protein homolog
Arabidopsis	`AT2G37990` (AT2G37990) ribosome biosis regulatory protein (RRS1) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818377] identity=64.4; qcov=0.973; evalue=6.93e-146; confidence=high
Rice	`Os04g0685100` - identity=63.6; qcov=0.918; evalue=7.14e-137; confidence=high
GO	GO:0000055 (ribosomal large subunit export from nucleus); GO:0000447 (endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0005515 (protein binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005730 (nucleolus); GO:0030687 (preribosome, large subunit precursor); GO:0042254 (ribosome biogenesis); GO:0042273 (ribosomal large subunit biogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF04939 (RRS1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020525

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805372.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057805372.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805372.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805372.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805372.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53005655`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B72,C10
`Chr4:53005655`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B72,C10
`Chr4:53005702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,D8
`Chr4:53005708`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B80
`Chr4:53005961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:53006208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr4:53008016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr4:53008480`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C57,C64,C66,C70
`Chr4:53009861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805372.1

329 aa

164

329

RRS1

PF04939 RRS1 6-168 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805372.1`	Pfam	`PF04939`	RRS1	Family	6	168	7.1e-54	182.8	Ribosome biogenesis regulatory protein (RRS1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949389.1
CAACACAAAATTAGGGCTACCAGCGAAGCCCGAATCGGAATTCTGCAGAGGCCCGAGCCCTAAAGTGTTAATTCCTTCTGCAAATCTGTGGGGTTTTGGGGTTTTTGCCGTTTCAACACCTACCTCTACCCTCCCGCCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTTACACACAGAGACTGAAATGGAGGAAGCACAGTACGAAATCGATTTGGGCAACCTTATGGCCTTCGACCGGAACCATCAATTCGCGTCTCCCCCAACTTCCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020525
ATGGAGGAAGCACAGTACGAAATCGATTTGGGCAACCTTATGGCCTTCGACCGGAACCATCAATTCGCGTCTCCCCCAACTTCCAGGGAGGAGATTGTAAAGGAAACAGTTGAACAGGCCACCAAATTGGTTCAAGCAGTTGCAGATGCCCTTTTCAATTTGCCTTCGACGGAGGATCCTGACGGCCCACTCGTCAAGTTGCCTGCACCTACTACCAAATTGCCCAGAGAAAAACCTCTTCCGAAGCCTAGACCTCCTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805372.1
MEEAQYEIDLGNLMAFDRNHQFASPPTSREEIVKETVEQATKLVQAVADALFNLPSTEDPDGPLVKLPAPTTKLPREKPLPKPRPPTQWEVFAQQKGIQKRKKEKMAFDEQTGTWKRRHGYDRLNDDNDIPIIEAKATDEPGTDPFAERRKEKKSRVDKQEGNRLNNLKNAQKAGALPSHIQLAATALPITGTQSQPKRVSKDVLQNVAGMAATATASGGKFDKKLPGEKPPKHEKKYRKYLPAVEGSGMGTLEKQQTEN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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