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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003657`

染色体: Chr04 坐标: 53051055-53061009 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003657`
名称	SmilChr04G003657
描述	actin-related protein 4
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53051055 - 53061009 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020529`
GeneID	`131020529`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020529`
原始查询	`SmilChr04G003657`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	actin-related protein 4
产物	actin-related protein 4
Arabidopsis	`AT1G18450` (ARP4) actin-related protein 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838425] identity=75.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0137200` (ARP4) - identity=69.9; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003682 (chromatin binding); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016514 (SWI/SNF complex); GO:0035267 (NuA4 histone acetyltransferase complex); GO:0043967 (GO:0043967)
KEGG	smil03082 (ATP-dependent chromatin remodeling - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00022 (Actin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020529

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805381.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057805381.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057805381.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057805381.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805381.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53057195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B133,C27
`Chr4:53059118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805381.1

435 aa

218

435

Actin

PF00022 Actin 4-435 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805381.1`	Pfam	`PF00022`	Actin	Family	4	435	9.9e-161	535.6	Actin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949398.1
AAAACCCCTAAGCCGCAACTCCACTTCTCTCTCTCTCTCCCGCGCGCAGTGAAGTCTCGTGGAAGGGAACTGTAATCCCCTTCATAAACCCTAATTCGCGCGCTCAAATCTCGAATAATTGGAAGTAAGGAGACCTGCTACACCCGATTCCAGCTTCCTACTCTCGTAATCGAACCGCCACTATCCAAGCCGTCGTCGAATCATCATGTATGGAGGAGATGAAGTATCGGCAATTGTCGTCGACTTGGGTTCCCATACCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020529
ATGTATGGAGGAGATGAAGTATCGGCAATTGTCGTCGACTTGGGTTCCCATACCTGCAAAGCTGGTTATGCTGGCGAAGATGCGCCGAAAGCTGTTTTCCCATCTGTTGTCGGGTCAATTGATGAAATGGAAATTGATGATGCTGATAATGCAAACAAGAACTCAGGATCTGCCCCAGATTCTAAATCAAAGGGCAAGAGCAAATATTTTGTTGGATCACAGGACTTGGGGTTTCGCAGGGATCACATGGAGGTATTATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805381.1
MYGGDEVSAIVVDLGSHTCKAGYAGEDAPKAVFPSVVGSIDEMEIDDADNANKNSGSAPDSKSKGKSKYFVGSQDLGFRRDHMEVLSPMKDGVVVDWDMVENIWDHALRKCLLIDPKEHPMLFAESCSNSQQQREKTAEIMFEKYQVPALFLAKNAVLTSFASGRATSLVVDCGGGSTTVAPVHDGYVLQKAVSTSPIGGDFLSDCLLKSLESKGHSIKPRYAFKRKEVRPGEFQIVDLDLPNTTESYRLYSQRVIVSDI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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