当前解析结果
SmilChr04G003663| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003663 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003663 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G003663 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 53087306 - 53089223 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020537 |
|---|---|
| GeneID | 131020537 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020537 |
| 原始查询 | SmilChr04G003663 |
| 来源 | GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818279]; symbol=AT2G37035; hit=AT2G37035; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818279]; symbol=AT2G37035; hit=AT2G37035; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT2G37035 (AT2G37035)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818279] identity=44.8; qcov=0.955; evalue=4.64e-106; confidence=medium |
| Rice | Os10g0478400- identity=35.1; qcov=0.563; evalue=1.15e-42; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | PF25105 (DUF7813) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020537 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 1.00000 | XP_057805408.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 1.00000 | XP_057805408.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057805408.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057805408.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057805408.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:53087662 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C68 |
Chr4:53088044 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C28 |
Chr4:53088256 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B94 |
Chr4:53088947 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A21 |
Chr4:53088965 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B38,B39,B71 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057805408.1PF25105
DUF7813 16-461 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057805408.1 |
Pfam | PF25105 |
DUF7813 | Family | 16 | 461 | 4.8e-198 | 659.7 | Family of unknown function (DUF7813) |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。