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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003665`

染色体: Chr04 坐标: 53095125-53098700 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003665`
名称	SmilChr04G003665
描述	3-isopropylmalate dehydrogenase, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53095125 - 53098700 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020538`
GeneID	`131020538`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020538`
原始查询	`SmilChr04G003665`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	3-isopropylmalate dehydrogenase, chloroplastic-like
产物	3-isopropylmalate dehydrogenase%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT5G03290` (IDH-V) isocitrate dehydrogenase V [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831884] identity=83.3; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0276100` (OsIDHa) - identity=82.8; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000287 (magnesium ion binding); GO:0004449 (isocitrate dehydrogenase (NAD+) activity); GO:0005739 (mitochondrion); GO:0006099 (tricarboxylic acid cycle); GO:0006102 (isocitrate metabolic process); GO:0051287 (NAD binding)
KEGG	smil00020 (Citrate cycle (TCA cycle) - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01200 (Carbon metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01210 (2-Oxocarboxylic acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01230 (Biosynthesis of amino acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00180 (Iso_dh)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020538

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057805409.1`
2	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.40000	`XP_057805409.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805409.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805409.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805409.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53095575`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:53095591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr4:53096083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C28,D11
`Chr4:53096904`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,B36
`Chr4:53097244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B39,C28
`Chr4:53097411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:53098436`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B39
`Chr4:53098510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:53098533`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	27	A18,A22,A5,B104,B115,B117,B121,B137,B17,B23,B29,B44,B51,B65,B67,B90,B92,C13,C27,C30,C46,C48,C56,C6,D10,D2,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805409.1

371 aa

186

371

Iso_dh

PF00180 Iso_dh 44-367 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805409.1`	Pfam	`PF00180`	Iso_dh	Domain	44	367	1.5e-106	357.4	Isocitrate/isopropylmalate dehydrogenase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949426.1
GTATAAACTTTACAGCCGCTGACTCGACCTCTCAATTGTTCAAAAAGACGCACGCCTCTTTTCAAACTCCTTTTGTTTTTCATTAACACACTGAAAATCAATCAAAATCGGCTAATTGAAGGAGCTTCGGAAATTCGAGTTCGTTAACCACAATCTCTATCAATCAATGGCATCGCAGATCGTGAGACGACTTGCTCGGAGCCGAGCCTCTGGTTTCTTCTCCTCCGCGAACCCTAGTTTCTTGGGTCGGAGTTTCTCAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020538
ATGGCATCGCAGATCGTGAGACGACTTGCTCGGAGCCGAGCCTCTGGTTTCTTCTCCTCCGCGAACCCTAGTTTCTTGGGTCGGAGTTTCTCATCGACGGCGGCATCCGAATCCAACCTGATCCGCGCCACTCTCTTCCCCGGAGATGGAATTGGTCCGGAGATCGCCGATTCGGTGAAACAGATATTTAAAGTTGCTGACTGTCCAATTGAATGGGAAGAACACTTTGTGGGGACGGAGATAGATCCTAGAACCCAGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805409.1
MASQIVRRLARSRASGFFSSANPSFLGRSFSSTAASESNLIRATLFPGDGIGPEIADSVKQIFKVADCPIEWEEHFVGTEIDPRTQSFLTWESLESVRRNKVGLKGPMATPIGKGHRSLNLTLRKELNLYANVRPCYSLPGYKTKYDDVDLITIRENTEGEYSGLEHQVVRGVVESLKIITRQASLRVAEYAFYYAKTHGRQRVSAIHKANIMQKTDGLFLKCCREVAEKYPEITYEEVVIDNCCMMLVKNPALFDVLVM...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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