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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003676`

染色体: Chr04 坐标: 53215349-53216561 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003676`
名称	SmilChr04G003676
描述	uncharacterized SmilChr04G003676
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53215349 - 53216561 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020551`
GeneID	`131020551`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020551`
原始查询	`SmilChr04G003676`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=23.1; qcov=0.746; evalue=6.15e-06; confidence=weak
Rice	`Os02g0328500` - identity=29; qcov=0.444; evalue=3.25e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020551

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805431.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805431.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805431.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805431.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805431.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53215576`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B128,B22
`Chr4:53215594`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr4:53215618`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B112
`Chr4:53215643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B135,B18,C58
`Chr4:53215657`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr4:53215693`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A20,B122,B132,B16,B20,C18,C35,C52,C80,D9
`Chr4:53215698`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A20,B122,B132,B16,B20,C18,C35,C52,C80,D9
`Chr4:53215702`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B20,C18,C35,C52
`Chr4:53215702`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B20,C18,C35,C52
`Chr4:53215707`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	8	A20,B122,B132,B16,B20,C35,C80,D9
`Chr4:53215727`	`CCT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A21,B10,B52,B53,B81,C42,C50,C6,D10
`Chr4:53215733`	`G`	`GTC`	2bp_insertion	frameshift_variant	9	A21,B10,B52,B53,B81,C42,C50,C6,D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949448.1
AACTAGGTCGTGTCCGTCTGAATAAGACGGATAAGACACGGAGGAGTTGGACAGGTAAGGAAGAGGAAGTACTAATGGCTTCGTTGAAGGAGTTGGTGGTCCAAGGCTGGAAGTCGGACAACGGGTTTAGGGCGGGATACCTAACTAAACTCGAGGAGGCGATGAAGGCTGCGTTTCCAGAGACGGATCTCAAAGGTTCCCCGCACATAAACTCTAAGATATGTGCGTGGAAAAAAAATTACTATAGCTTGTCACAAATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020551
ATGGCTTCGTTGAAGGAGTTGGTGGTCCAAGGCTGGAAGTCGGACAACGGGTTTAGGGCGGGATACCTAACTAAACTCGAGGAGGCGATGAAGGCTGCGTTTCCAGAGACGGATCTCAAAGGTTCCCCGCACATAAACTCTAAGATATGTGCGTGGAAAAAAAATTACTATAGCTTGTCACAAATGTTATCCCGCAGTGGAATTGGGTTTAACACCAATGGTGACTATTTGATTGATTGCTCAAATGAAATGTGGGAGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805431.1
MASLKELVVQGWKSDNGFRAGYLTKLEEAMKAAFPETDLKGSPHINSKICAWKKNYYSLSQMLSRSGIGFNTNGDYLIDCSNEMWEQIVKCDPNARLMRYKPWPMLEDWKEVFGKDRATGEQAEDLMDAVNEMHRREHVVLNTPESDYHVNLDDILDHETVDESVGQSSKETPTAGVVGRKRKQRDDMSGLCEVLREINRTTDRRLENLANRIGYDFDMGKARQEVFDQLGCISSFTMEDKFDVCELLADKIERLEIFRG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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