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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003677`

染色体: Chr04 坐标: 53217816-53219428 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003677`
名称	SmilChr04G003677
描述	aquaporin PIP2-1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53217816 - 53219428 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020552`
GeneID	`131020552`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020552`
原始查询	`SmilChr04G003677`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aquaporin PIP2-1-like
产物	aquaporin PIP2-1-like
Arabidopsis	`AT3G53420` (PIP2A) plasma membrane intrinsic protein 2A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824510] identity=81.5; qcov=1.01; evalue=1.47e-167; confidence=high
Rice	`Os02g0629200` (OsPIP2) - identity=79.7; qcov=1.02; evalue=3.99e-166; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0015250 (water channel activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00230 (MIP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020552

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057805432.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805432.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805432.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805432.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805432.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53218010`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B4,B5,D11
`Chr4:53218082`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr4:53218100`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr4:53218421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C5,C67
`Chr4:53218493`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B78,B96
`Chr4:53218535`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B75,B85,C49,D2,D4
`Chr4:53218547`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:53218888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C5,C67
`Chr4:53218983`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	A14,B57,B99,C21,C37,C39,C55,C60,C70
`Chr4:53219129`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B119,B130,B63,C12
`Chr4:53219154`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:53219172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B28,C77,C81

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805432.1

283 aa

142

283

MIP

PF00230 MIP 33-263 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805432.1`	Pfam	`PF00230`	MIP	Family	33	263	2.8e-84	283.1	Major intrinsic protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949449.1
GGCAAAATTCAACCTACATTATCCAAAATTTTAAATACTCTCTCAAAATTCCATATAAATACCACTGCAACACCAATCTACAAATCATCAACACAAAAATTGTTAGTAAACAGTCAAACTCAATTCAATCTTGAAATAAAGAAAATGGGTAAAGATATCGAGGTCGGAGCCACCGGCGAGTACGGCGGCGGCAAGGACTACCAAGATCCTCCGCCGGCGCCCTTGATCGACGTGGAGGAGCTGGGAAAGTGGTCATTTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020552
ATGGGTAAAGATATCGAGGTCGGAGCCACCGGCGAGTACGGCGGCGGCAAGGACTACCAAGATCCTCCGCCGGCGCCCTTGATCGACGTGGAGGAGCTGGGAAAGTGGTCATTTTACAGAGCCATCATCGCTGAATTCGTCGCAACCCTTCTGTTCCTCTACGTCACTGTCCTCACCGTCATCGGTTACAAGAGCCAGAGCGCCGCCGACGAGTGCGGCGGCGTTGGCATTCTCGGCATCGCCTGGGCCTTCGGCGGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805432.1
MGKDIEVGATGEYGGGKDYQDPPPAPLIDVEELGKWSFYRAIIAEFVATLLFLYVTVLTVIGYKSQSAADECGGVGILGIAWAFGGMIFILVYCTAGISGGHINPAVTFGLLLARKVSLVRAVLYMAAQCLGAVCGCGLVKAFQKAYYVNYGGGANELADGYSTGTGVAAEIIGTFVLVYTVFAATDPKRNARDSHVPVLAPLPIGFAVFMVHLATIPITGTGINPARSFGAAVIYGKDKAWDDQWIFWVGPFVGAAIAA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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