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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003682`

染色体: Chr04 坐标: 53258008-53259503 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003682`
名称	SmilChr04G003682
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 12
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53258008 - 53259503 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020559`
GeneID	`131020559`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020559`
原始查询	`SmilChr04G003682`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 12
产物	fasciclin-like arabinogalactan protein 12
Arabidopsis	`AT5G03170` (FLA11) FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831914] identity=54.1; qcov=0.659; evalue=1.67e-56; confidence=high
Rice	`Os05g0163300` (OsFLA9) - identity=51.1; qcov=0.698; evalue=1.32e-44; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02469 (Fasciclin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020559

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057805442.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.40000	`XP_057805442.1`
3	Secreted	分泌到胞外	0.20000	`XP_057805442.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805442.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805442.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53258653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:53258689`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B54
`Chr4:53258712`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,B85
`Chr4:53258713`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B72
`Chr4:53258713`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B72
`Chr4:53258716`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:53258725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B130,B63
`Chr4:53258835`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr4:53258938`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	B106,B119,B62,B83,C35,C42,C56,C59,D2,D6
`Chr4:53258972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C49
`Chr4:53258972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr4:53259284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B140,D5,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805442.1

258 aa

129

258

Fasciclin

PF02469 Fasciclin 65-198 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805442.1`	Pfam	`PF02469`	Fasciclin	Domain	65	198	5.2e-19	69.4	Fasciclin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949459.1
CTCCAAATACATATCATTGATTCATTATCAAGTATTACAGATAATCATTAAGGGATTGTTTGCTTTGGATGGTACTCAAAATTGTTCAATCAACCATTAGCCTATATTATTTTTACATATCTAAGCTCACCCATGACCCAACATAAACACCTCTAAAAAAGGAACAGGATATATAGTAGGAGTATTAAATTTAACAGAAGGCTGAGAATAATAAATGCAGGTTTCATTTTTCTTTTTCTTTTTTTTCTGGAGAAAAATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020559
ATGATTCAGCTACTCATCCCATTCCCAGTTCCCTTCCTCTTCCTCTTCCTCTTTTGCTGCACCCTTACTGCTGCTGCACAGCCCCTCGCAGCAGCCCCTGCATTGTCCGTGCCAAGCGCGCCGACTACTGTGGCAGCTAGCCCTGCGCCGACTGGGCCGGACAGTGTGATCTCCATCCTCAAAAAGGATGGAAGGTTCGGTGTGTTCATCAAACTTCTGCAGAGCACTAAGGTTGCAGATAACCTTGACTCACAACTTAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805442.1
MIQLLIPFPVPFLFLFLFCCTLTAAAQPLAAAPALSVPSAPTTVAASPAPTGPDSVISILKKDGRFGVFIKLLQSTKVADNLDSQLIDSSNGLTVFAPTDSAFSNLKTGTLNSFTDEQKTELVQFHVLTSHISPSQFQTASNPLRTQAGGSTELLAMNVTAIGSLVNITTGETNTSVSNTIFDDNQLAVYQVDKVLLPMRFYVPLPPPPPPPPPPKTPSPKASPVYVAPVDSSTNKCLSEKKALYATACFMLVLAAFP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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