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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003684`

染色体: Chr04 坐标: 53261147-53264416 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003684`
名称	SmilChr04G003684
描述	dnaJ protein P58IPK homolog A-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53261147 - 53264416 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020564`
GeneID	`131020564`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020564`
原始查询	`SmilChr04G003684`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dnaJ protein P58IPK homolog A-like
产物	dnaJ protein P58IPK homolog A-like
Arabidopsis	`AT5G03160` (P58IPK) DnaJ P58IPK-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831917] identity=67.9; qcov=0.533; evalue=1.46e-19; confidence=low
Rice	`Os02g0195300` (OsDjC16) - identity=74.1; qcov=0.552; evalue=2.51e-23; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005788 (endoplasmic reticulum lumen)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020564

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805450.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057805455.1`
3	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057805450.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057805450.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805455.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53261586`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr4:53262105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B111,B123,B14,B26
`Chr4:53262146`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A10,A16,A19,A20,A6,B106,B111,B113,B114,B117,B118,B127,B14,B140,B17,B18,B22,B23,B25,B42,B43,B49,B53,B55,B6,B65,B7,B78,B84,B89,B97,C22,C26,C42,C51,C55,C63,C71,C8,C81,C82,D7
`Chr4:53262161`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C53
`Chr4:53262161`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C53
`Chr4:53262168`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A20,B57,C39
`Chr4:53262169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:53262185`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	42	A10,A19,A20,A6,B106,B111,B113,B114,B117,B118,B120,B127,B137,B14,B140,B18,B22,B23,B25,B33,B42,B43,B49,B53,B55,B65,B8,B89,B97,C18,C22,C26,C3,C38,C51,C55,C62,C63,C8,C82,D3,D7
`Chr4:53262217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B4,C53,D11
`Chr4:53262305`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B134,D8
`Chr4:53262328`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B139,B26,B45,B62
`Chr4:53262328`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B139,B26,B45,B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949471.1
ATTTTTGATAATAAATTATGTTATCTAATTTTTTAGTACTGAGCGAAGAAATACAGTGAGGCCCTTTCTAAACTTAATGCTGCTATAGAGGCAAATCCAGCACTCGCAGAAGCATATCGGCATCGGGCATCCATTCTATGTCAACTGTGCAGCCACTGAGTTACATGAAAAGGGCAGCAGCTACACTTGTTCTGGTCTGAGCAGACTACCAGCTGGAGGTTTAGAGCATTAAGTCATGGAAGAGCTCAAGGCCTCCAAAG...

XM_057949470.1
TTTTTGATAATAAATTATGTTATCTAATTTTTTAGTACTGAGCGAAGAAATACAGTGAGGCCCTTTCTAAACTTAATGCTGCTATAGAGGCAAATCCAGCACTCGCAGAAGCATATCGGCATCGGGCATCCATTCTATGTCAACTGTGCAGCCACTGAGTTACATGAAAAGGGCAGCAGCTACACTTGTTCTGGTCTGAGCAGACTACCAGCTGGAGGTTTAGAGCATTAAGTCATGGAAGAGCTCAAGGCCTCCAAAGC...

CDS

6 records

下载 CDS FASTA

LOC131020564
ATGATAATGCAAGCAATGGTGAAACTTGGTAGGGGAGACGATGCTGTGACAAGTTGCACAGAAGCACTTGAAATTGATGGAGATTTAGTTGAAGCACTAGTCCAGAGAGGTGAGGCGAAGCTTTTAGTTGAAGATTGGGAAGGAGCTGTGGCTGACCTAAGATCAGCAGCAGAGAAGTCACCTCGGATTTTGGGGTATGAGGATAAGCGCACAAGATATGACAGTGGTGAAGATATTGATGGCATGGGGATGAATAAAGG...

Protein

6 records

下载 Protein FASTA

XP_057805450.1
MIMQAMVQVKLGRGDDAVTSCTEALEIDGDLVEALVQRGEAKLLVEDWEGAVADLRSAAEKSPRILGYEDKRTRYDSGEDIDGMGMNKGGGGFNLFGGGGQQFTFHFQGGYPGGFGGF

XP_057805451.1
MIMQAMVQVKLGRGDDAVTSCTEALEIDGDLVEALVQRGEAKLLVEDWEGAVADLRSAAEKSPRILGYEDKRTRYDSGEDIDGMGMNKGGGGFNLFGGGGQQFTFHFQGGYPGGFGGF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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