当前解析结果
SmilChr04G003687| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003687 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003687 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G003687 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 53277045 - 53283967 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020561 |
|---|---|
| GeneID | 131020561 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020561 |
| 原始查询 | SmilChr04G003687 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020561 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057805444.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057805444.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057805444.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057805444.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057805444.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:53277117 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr4:53277133 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 42 | A18,A23,B105,B106,B111,B119,B123,B129,B130,B133,B134,B14,B18,B23,B26,B37,B47,B5,B62,B68,B74,B8,B83,B87,B99,C10,C14,C17,C28,C35,C4,C42,C58,C59,C76,C80,C86,D10,D2,D3,D4,D8 |
Chr4:53277148 |
G |
GC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 10 | A23,B112,B137,B38,B82,B90,B92,C20,C5,C78 |
Chr4:53277161 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D8 |
Chr4:53277174 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B78,B81,C8 |
Chr4:53277185 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 136 | A10,A11,A13,A14,A19,A2,A21,A22,A23,A24,A4,A6,A7,A8,A9,B10,B102,B103,B108,B11,B111,B112,B114,B117,B118,B12,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B135,B136,B137,B138,B15,B17,B2,B23,B24,B28,B29,B30,B31,B32,B33,B35,B37,B38,B39,B40,B41,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B55,B57,B59,B6,B60,B61,B63,B66,B69,B70,B73,B76,B77,B79,B8,B81,B82,B83,B86,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B95,B97,B98,C1,C12,C13,C15,C16,C18,C2,C20,C21,C28,C29,C30,C33,C37,C4,C41,C46,C47,C48,C5,C52,C55,C57,C59,C6,C60,C63,C65,C67,C68,C7,C70,C72,C77,C78,C81,C84,C85,C87,C9,D3,D7 |
Chr4:53277190 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B78 |
Chr4:53277250 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B4 |
Chr4:53277256 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr4:53277303 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B18,C62 |
Chr4:53277312 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B73 |
Chr4:53277352 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B93,C11,C69 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
4 records
下载 cDNA FASTA4 records
下载 CDS FASTA4 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。