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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003696`

染色体: Chr04 坐标: 53332241-53333104 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003696`
名称	SmilChr04G003696
描述	uncharacterized SmilChr04G003696
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53332241 - 53333104 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020570`
GeneID	`131020570`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020570`
原始查询	`SmilChr04G003696`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF1685 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818876]; symbol=AT2G42760; hit=AT2G42760; species=arabidopsis; confidence=low
产物	DUF1685 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818876]; symbol=AT2G42760; hit=AT2G42760; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G42760` (AT2G42760) DUF1685 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818876] identity=41.7; qcov=0.34; evalue=1.05e-08; confidence=low
Rice	`Os06g0550800` - identity=27.9; qcov=0.642; evalue=1.16e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020570

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057805468.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057805468.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057805468.1`
4	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057805468.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805468.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53332361`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B54
`Chr4:53332361`	`A`	`AAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B54
`Chr4:53332377`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B114,B28,B44,C60
`Chr4:53332377`	`A`	`ATT`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B114,B28,B44,C60
`Chr4:53332378`	`TTA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	48	A13,A15,A2,A22,A3,A4,A7,A9,B100,B109,B112,B115,B120,B127,B131,B135,B15,B17,B19,B2,B25,B27,B46,B73,B74,B97,C14,C17,C19,C23,C26,C31,C35,C39,C4,C42,C44,C51,C58,C62,C74,C80,C81,C82,D2,D6,D8,D9
`Chr4:53332464`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B131
`Chr4:53332606`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B61,C28,C36,C83
`Chr4:53332758`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr4:53332767`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B4
`Chr4:53332953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B42,B43,B94,C54
`Chr4:53332987`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	D10
`Chr4:53332987`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949485.1
GAACAAGCTTCCCCAACTCATCACCACACTTTTCTTCATTCCCCATATTCCCTTTTTCTAAAACAATACCACGACACTCCCATAAACAATATGTATATATATATTTCACCACATTATACAAATATATATATACATCATTATATATCAGAGATGGCAGCACAGAAATGTGGGATGTGCCCATTTGAGGCCATGGATCACCTCTGGTTTCACCAGATTGTTATTTCCTCAAAATTTTCATCAAAAAACATCTCAACCCAACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020570
ATGTATATATATATTTCACCACATTATACAAATATATATATACATCATTATATATCAGAGATGGCAGCACAGAAATGTGGGATGTGCCCATTTGAGGCCATGGATCACCTCTGGTTTCACCAGATTGTTATTTCCTCAAAATTTTCATCAAAAAACATCTCAACCCAACATATATCTTCACAGGTTGAGAGCAGGAGACAAGAAAGTGATCATGTTGAAGAAACTACCGCTACAGCTGATCAGGATAGAGCAACAAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805468.1
MYIYISPHYTNIYIHHYISEMAAQKCGMCPFEAMDHLWFHQIVISSKFSSKNISTQHISSQVESRRQESDHVEETTATADQDRATKLYLVSRETRSHSSSPASLKKQSRILPGSVDLELQEVKGFMDLGFVFKEHNLSSHVISLIPGLRRIKSQDKRGILKPYLSESWLVRMPDSPLVLSLRISRVCNDSDKVKKHLKDWARTVAAAIHQEF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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