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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003703`

染色体: Chr04 坐标: 53370634-53372881 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003703`
名称	SmilChr04G003703
描述	tubulin-folding cofactor A
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53370634 - 53372881 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020577`
GeneID	`131020577`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020577`
原始查询	`SmilChr04G003703`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	tubulin-folding cofactor A
产物	tubulin-folding cofactor A
Arabidopsis	`AT2G30410` (KIS) tubulin folding cofactor A (KIESEL) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817592] identity=77; qcov=1; evalue=5.82e-61; confidence=high
Rice	`Os02g0816500` (P0643F09.19-2) - identity=86.9; qcov=0.743; evalue=4.24e-48; confidence=medium
GO	GO:0005829 (cytosol); GO:0007021 (tubulin complex assembly); GO:0007023 (post-chaperonin tubulin folding pathway); GO:0015630 (microtubule cytoskeleton); GO:0048487 (beta-tubulin binding)
KEGG	-
Pfam	PF02970 (TBCA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020577

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057805475.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057805475.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057805475.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057805475.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805475.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53370819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:53370826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr4:53371754`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr4:53372510`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C21
`Chr4:53372555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96
`Chr4:53372557`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B46,B93
`Chr4:53372593`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B96

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805475.1

113 aa

113

TBCA

PF02970 TBCA 3-101 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805475.1`	Pfam	`PF02970`	TBCA	Domain	3	101	2e-30	105.7	Tubulin binding cofactor A

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949492.1
TATTGGTTTAATATTTATGGAAGCGTAGATCTCCCGCAGAAATCAAGTAAGCTCTCTCCCTCACAGAAGTAATTCCAGAAACTGCGTCTAGTAGAAAGACAACAATGGCGACATTGAGGAACTTGAAGATAAAGACATCAACGTGCAAGAGAATAGCCAAGGAGCTTCACTCCTATGAGAAAGAGGTCGAAACAGAGTCTGCTAAAACCGCCGATATGAAGGCAAAAGGCGCCGATCCATATGATCTCAAACAGCAGGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020577
ATGGCGACATTGAGGAACTTGAAGATAAAGACATCAACGTGCAAGAGAATAGCCAAGGAGCTTCACTCCTATGAGAAAGAGGTCGAAACAGAGTCTGCTAAAACCGCCGATATGAAGGCAAAAGGCGCCGATCCATATGATCTCAAACAGCAGGAAAATGTGCTGGCTGAATCTAGGATGATGGTTCCTGACTGCCGCAAGCGTCTAGAGGCTGCTCTAAGTGATCTTAAAGGCACTCTGGTCGAGCTGGAGGAGTCTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805475.1
MATLRNLKIKTSTCKRIAKELHSYEKEVETESAKTADMKAKGADPYDLKQQENVLAESRMMVPDCRKRLEAALSDLKGTLVELEESGQKEGSEIDDARSTITDVEQIFQSSDA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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