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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003704`

染色体: Chr04 坐标: 53373631-53375412 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003704`
名称	SmilChr04G003704
描述	trihelix transcription factor ASIL1-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53373631 - 53375412 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020578`
GeneID	`131020578`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020578`
原始查询	`SmilChr04G003704`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	trihelix transcription factor ASIL1-like
产物	trihelix transcription factor ASIL1-like
Arabidopsis	`AT2G44730` (AT2G44730) Alcohol dehydrogenase transcription factor Myb/SANT-like family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819080] identity=40.8; qcov=0.991; evalue=3.63e-69; confidence=medium
Rice	`Os10g0564200` - identity=59.4; qcov=0.202; evalue=6.29e-22; confidence=weak
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF10545 (MADF_DNA_bdg); PF13837 (Myb_DNA-bind_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020578

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805476.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805476.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805476.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805476.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805476.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53373931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B115,C58,C80
`Chr4:53373989`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B66,B7,C83
`Chr4:53374052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,C13
`Chr4:53374061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C85
`Chr4:53374061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr4:53374145`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr4:53374153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:53374198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B50
`Chr4:53374284`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B17,B69,C14,C42
`Chr4:53374297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B128
`Chr4:53374346`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68
`Chr4:53374519`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C78,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805476.1

341 aa

170

341

Myb_DNA-bind_4

MADF_DNA_bdg

PF13837 Myb_DNA-bind_4 41-133 aa PF10545 MADF_DNA_bdg 63-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805476.1`	Pfam	`PF13837`	Myb_DNA-bind_4	Domain	41	133	6.9e-18	65.6	Myb/SANT-like DNA-binding domain
`XP_057805476.1`	Pfam	`PF10545`	MADF_DNA_bdg	Domain	63	131	5.6e-09	36.9	Alcohol dehydrogenase transcription factor Myb/SANT-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949493.1
ACCTTTTAAAGAAAACATTTTCTAACAAAAAATAAATAAGGAAAAAGTGGGCATAGTTAATATGAGGAGAATGAGAGAGAGTGGCACATAAAAGGCCTCCCCCAAATTTGAGAATTACGTAAAGGAGAGGAAAAAAAAAAGAAAAGATAAAAAAGAAAAACCCACGCGGCGACGCCTCTGGTTCCGCGCACGTTAACAGCCCCGCCCGCCCATCCTCGACCCCCCCAGGGCGCACGATAGCCTGCCCTCCCTAAGCGGTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020578
ATGGCCGCCAGCCTATCCCCCTCCTCCACCTCCAACCACGACGACGACAACAACAGCCACATCCCCACGGCCACCCTAGCCCTCCCCTCCACCTCCTCCGTCTCCCGACGCCTCCCGCCGCCGTGCTGGTCCCCCGATGAGACCGTCGCCCTAATCGATGCCTACAAGGACAAGTGGTACTCCCTCCGCCGCGGCAACCTCAAAGCCACCCACTGGCAGGAGGTCGCCGACGACGTCGCCGCCAGGTGCCCCGCCAGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805476.1
MAASLSPSSTSNHDDDNNSHIPTATLALPSTSSVSRRLPPPCWSPDETVALIDAYKDKWYSLRRGNLKATHWQEVADDVAARCPASPPKTPVQCRHKMEKLRKRYRSEIQRAAAHGGVRRFTSSWVHFQSMYSMEKGPNPAPSSSSSSDEEDYNNNNSVKRINDLYNYNQKGAYGSQLPENNGAASGFRIKIPGRATAGPTVAKVYSKFDEMGGPNPTNPNPRFTNYAAGVNGAASSKISRDNFVGVGQIRKRAGEIPKK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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