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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003709`

染色体: Chr04 坐标: 53412271-53414007 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003709`
名称	SmilChr04G003709
描述	11-hydroxysugiol 20-monooxygenase
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53412271 - 53414007 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020584`
GeneID	`131020584`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020584`
原始查询	`SmilChr04G003709`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	11-hydroxysugiol 20-monooxygenase
产物	11-hydroxysugiol 20-monooxygenase
Arabidopsis	`AT2G45550` (CYP76C4) cytochrome P450, family 76, subfamily C, polypeptide 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819163] identity=42.5; qcov=0.988; evalue=1.62e-147; confidence=medium
Rice	`Os03g0248200` - identity=43.5; qcov=0.968; evalue=3.65e-140; confidence=medium
GO	GO:0004497 (monooxygenase activity); GO:0005506 (iron ion binding); GO:0016705 (oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen); GO:0020037 (heme binding)
KEGG	smil00904 (Diterpenoid biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00067 (p450)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020584

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057805482.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057805482.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805482.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805482.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805482.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53412363`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B41
`Chr4:53412400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B75,B96,C62
`Chr4:53412416`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B114,B96,C62
`Chr4:53412416`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B114,B96,C62
`Chr4:53412418`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B114,B96,C62
`Chr4:53412418`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B114,B96,C62
`Chr4:53412450`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B58,B80
`Chr4:53412450`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B58,B80
`Chr4:53412452`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B58,B80
`Chr4:53412565`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,B122,B81,C80
`Chr4:53412593`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	170	A1,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A21,A22,A23,A24,A4,A6,A7,A8,B1,B10,B100,B103,B106,B108,B109,B11,B110,B111,B113,B114,B115,B117,B118,B12,B120,B122,B128,B130,B133,B134,B136,B137,B139,B140,B16,B19,B20,B21,B23,B25,B26,B27,B29,B3,B30,B31,B32,B33,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B56,B58,B61,B62,B64,B66,B68,B69,B7,B70,B74,B75,B76,B77,B79,B8,B81,B82,B87,B88,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,C10,C12,C13,C14,C15,C17,C18,C19,C2,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C35,C36,C37,C38,C39,C40,C42,C44,C45,C47,C5,C50,C51,C52,C54,C55,C59,C6,C60,C63,C65,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C79,C80,C82,C83,C84,C85,C9,D1,D2,D3,D4,D5,D8
`Chr4:53412605`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	59	A1,A11,A13,A18,B101,B102,B111,B112,B114,B117,B121,B124,B125,B127,B13,B132,B133,B19,B2,B22,B25,B28,B3,B39,B40,B47,B48,B53,B61,B64,B67,B69,B71,B73,B76,B79,B80,B83,B85,B87,B97,B98,C11,C14,C20,C23,C27,C32,C41,C43,C46,C47,C50,C59,C62,C69,C81,C87,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805482.1

503 aa

252

503

p450

PF00067 p450 35-491 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805482.1`	Pfam	`PF00067`	p450	Domain	35	491	7.7e-97	325.7	Cytochrome P450

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949499.1
GAACACTAAACTTCTATAAATGAGGGAGCATGCATGAAAAACTAGAAACAAAACAAACGAAAAATGCAAGTTTTAATAGTTGCATCCCTAGCCTTTCTAGCGGCATGGCTCGTCTACTCAAGGTGGTCGGACTCCCGGCGGCGGCGGGGAGGAGGAGGCTCGCTCCCCCCGGGGCCGCCTCGTCTGCCCATCATCGGCAACATGCACCAGCTCGGCCCAAACCCGCACAAGTCCCTCGCCCACCTCGCTAAGACATACGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020584
ATGCAAGTTTTAATAGTTGCATCCCTAGCCTTTCTAGCGGCATGGCTCGTCTACTCAAGGTGGTCGGACTCCCGGCGGCGGCGGGGAGGAGGAGGCTCGCTCCCCCCGGGGCCGCCTCGTCTGCCCATCATCGGCAACATGCACCAGCTCGGCCCAAACCCGCACAAGTCCCTCGCCCACCTCGCTAAGACATACGGCCCCTTGATGTCCCTCAAGCTCGGGAATCAACTCGCCGTGGTGGCCTCGTCGCCGGAGATGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805482.1
MQVLIVASLAFLAAWLVYSRWSDSRRRRGGGGSLPPGPPRLPIIGNMHQLGPNPHKSLAHLAKTYGPLMSLKLGNQLAVVASSPEMAREVLIKQGVALCRPFTPNAVCIHGHGEVSVLMLPATSNIWKRIRRIAREKLFSNPALQGTQDIRRERLRKLTDYAAGCSREGRAMNVGEATFTTMSNLMFATLFSIELTEYGASDAGANRKFREHVNAITTNMGVPNVADFFPIFAPLDPQGLRRKLTHHLGSLLELVQNLID...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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