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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003719`

染色体: Chr04 坐标: 53540493-53543900 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003719`
名称	SmilChr04G003719
描述	probable metal-nicotianamine transporter YSL8
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53540493 - 53543900 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020596`
GeneID	`131020596`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020596`
原始查询	`SmilChr04G003719`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable metal-nicotianamine transporter YSL8
产物	probable metal-nicotianamine transporter YSL8
Arabidopsis	`AT1G65730` (YSL7) YELLOW STRIPE like 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842884] identity=69.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os04g0674600` (OsYSL10) - identity=68.4; qcov=1.02; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane); GO:0035673 (oligopeptide transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF03169 (OPT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020596

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057805493.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057805493.1`
3	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057805493.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805493.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805493.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53540711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B12,C61,C84
`Chr4:53540778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B119,C56
`Chr4:53540850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:53540880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B48,B71,C78,D5
`Chr4:53540891`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B59,D11
`Chr4:53541191`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr4:53541218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr4:53541571`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B33
`Chr4:53541571`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B33
`Chr4:53541769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr4:53542759`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B48,C78
`Chr4:53542778`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805493.1

624 aa

312

624

OPT

PF03169 OPT 2-598 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805493.1`	Pfam	`PF03169`	OPT	Family	2	598	5.9e-156	521.4	OPT oligopeptide transporter protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949510.1
AATCATTCCAAACTTTGCTACAACATTCATGGAGAGGCCAAACGAAGACAACGCAGTCGAAGTCGTAGACGAAGAAGAAGAAGAGAGGAGGAAGAGCTGACAGTGGAGCAGATATTCGAGAAGAAGGAGAAGGTGGTGCCATGGAGGCAGCAGCTGACAGTGAGGGCATTCGCCGTCAGCTTCCTTTTGTCGATCATGTTCTCCTTCATAGTGATGAAGCTCAACCTCACCACCGGAATCATCCCTTCCTTGAACGTCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020596
ATGTTCTCCTTCATAGTGATGAAGCTCAACCTCACCACCGGAATCATCCCTTCCTTGAACGTCGCAGCCGGCCTCTTGGGCTTCTTCTTCGTCAAGATCTCCACCAAGCTGCTCGACACCCTCGGCCTCTCGAGCCAGCCCTTCACGCGCCAGGAAAACACAGTCATTCAGACCTGCGTCGTTGCAGCCTCCGGCATTGCCTACAGTGGAGGGTTTGGGAGCTATCTGTTTGCAATGAGTGAACTTATCGTGCATCAATC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805493.1
MFSFIVMKLNLTTGIIPSLNVAAGLLGFFFVKISTKLLDTLGLSSQPFTRQENTVIQTCVVAASGIAYSGGFGSYLFAMSELIVHQSEPSSSDYKNPKLGWMIGFLFVVSFLGLFSLVPLRKMMIIDFKLTYPSGTATAHLINSFHTPQGAKLAKKQVRELGKFFSLSFMWSFFQWFFTAGNDCGFQKFPTFGLQALQHKFYFDFSATYIGVGMICPHIVNISLLIGGILSWGIMWPLIQTRKGHWYSADLDPSDIQALK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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