当前解析结果
SmilChr04G003724| 统一新 Gene ID | SmilChr04G003724 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr04G003724 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr04G003724 |
| 染色体 / SeqID | Chr04 / NC_080390.1 |
| 坐标与链方向 | 53574876 - 53577138 / - |
| NCBI Gene ID | LOC131020601 |
|---|---|
| GeneID | 131020601 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC131020601 |
| 原始查询 | SmilChr04G003724 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | elongation factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825136]; symbol=AT3G59670; hit=AT3G59670; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | elongation factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825136]; symbol=AT3G59670; hit=AT3G59670; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT3G59670 (AT3G59670)elongation factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825136] identity=28.6; qcov=0.93; evalue=4.63e-22; confidence=low |
| Rice | Os05g0365200 (OSJNBb0111K12.6)- identity=29.4; qcov=0.706; evalue=1.71e-17; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:131020601 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057805501.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057805501.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057805501.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057805501.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057805501.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr4:53575154 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr4:53575437 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B117,B35,D11 |
Chr4:53575602 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。