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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003728`

染色体: Chr04 坐标: 53613067-53615255 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003728`
名称	SmilChr04G003728
描述	uncharacterized SmilChr04G003728
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53613067 - 53615255 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020605`
GeneID	`131020605`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020605`
原始查询	`SmilChr04G003728`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT3G60410; symbol=AT3G60410; hit=AT3G60410; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	AT3G60410; symbol=AT3G60410; hit=AT3G60410; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G60410` (AT3G60410) - identity=39.9; qcov=0.504; evalue=5.23e-31; confidence=medium
Rice	`Os01g0689000` - identity=44.4; qcov=0.241; evalue=2.6e-13; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF07797 (DUF1639)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020605

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805507.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805507.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805507.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805507.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805507.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53613680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B104,B31,B75,D10
`Chr4:53613705`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B53,B71,D7
`Chr4:53614052`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B80,C43
`Chr4:53614053`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B78,B89,B97,C18,C35
`Chr4:53614058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr4:53614071`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,B80,B82
`Chr4:53614081`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C43
`Chr4:53614116`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C71
`Chr4:53614137`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr4:53614142`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B26,B72,B83,C43,C56
`Chr4:53614157`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B124,B21,B60,B78,C57
`Chr4:53614178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A1,B110,B21,C40,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805507.1

375 aa

188

375

DUF1639

PF07797 DUF1639 315-364 aa

XP_057805508.1

373 aa

186

373

DUF1639

PF07797 DUF1639 315-364 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805507.1`	Pfam	`PF07797`	DUF1639	Family	315	364	2.6e-27	95.2	Protein of unknown function (DUF1639)
`XP_057805508.1`	Pfam	`PF07797`	DUF1639	Family	315	364	2.6e-27	95.3	Protein of unknown function (DUF1639)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949524.1
GTGCCTGCGTGTGCGTGTTTGTGTGAGAGATACATCTACAAAAATGCATACACACGTCTGTATATATTATTAAATATATAATTATATTTAAGTTATTTGAATTTATATTAAGTTTCTTTTCCTCCACCTCACTTCTTCCCTTTCACCTTCTCTCTGCAACTTCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACAATCATCAATTCTGTTCTCTCAACCTTCATTCACGTTTACCCACAACAAAAACTTCATCCACACAGCTTAT...

XM_057949525.1
TGCCTGCGTGTGCGTGTTTGTGTGAGAGATACATCTACAAAAATGCATACACACGTCTGTATATATTATTAAATATATAATTATATTTAAGTTATTTGAATTTATATTAAGTTTCTTTTCCTCCACCTCACTTCTTCCCTTTCACCTTCTCTCTGCAACTTCGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTACAATCATCAATTCTGTTCTCTCAACCTTCATTCACGTTTACCCACAACAAAAACTTCATCCACACAGCTTATA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020605
ATGGCTTCTACTGTTCCTGCGAAATCTCAGCCGCTGCACAATTTTACGCTGCCGCATCTAAAATGGAATAAGGACCGAAACTCCAACGGCCACCACCAGCGCCGCCGCTCCATCAAATCGCCGTCGCGGCGGCCGAATATCTCTGCCGCGTCTCCTCTCCGCCAGTCACCGATGCGAGATTCCGTGTCGGCGACTCCACCTCGGCACCAGTCCCCGTTCCGCGACTCCACCGCGGCGGCGGCGGCGTCACCTCGTCGATC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805507.1
MASTVPAKSQPLHNFTLPHLKWNKDRNSNGHHQRRRSIKSPSRRPNISAASPLRQSPMRDSVSATPPRHQSPFRDSTAAAAASPRRSPVHGDYLGKRSPTPGEPFKPYPPREWGKHSPTGGDPAWHLPKHESPPQSEASGKGKGGFVEHRRHHSNNSALDGPRNGLHSTNSERTTQKSEPKSKAKEVDAAGIKRSKILIKIPCKSSKTEDENPQEEPLKTEKNDEDDCSGEVQEEEKINNNNIDEETKTWNLRPRKPLHK...

XP_057805508.1
MASTVPAKSQPLHNFTLPHLKWNKDRNSNGHHQRRRSIKSPSRRPNISAASPLRQSPMRDSVSATPPRHQSPFRDSTAAAAASPRRSPVHGDYLGKRSPTPGEPFKPYPPREWGKHSPTGGDPAWHLPKHESPPQSEASGKGKGGFVEHRRHHSNNSALDGPRNGLHSTNSERTTQKSEPKSKAKEVDAAGIKRSKILIKIPCKSSKTEDENPQEEPLKTEKNDEDDCSGEVQEEEKINNNNIDEETKTWNLRPRKPLHK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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