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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003731`

染色体: Chr04 坐标: 53626289-53630182 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003731`
名称	SmilChr04G003731
描述	transcription factor DUO1
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53626289 - 53630182 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020609`
GeneID	`131020609`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020609`
原始查询	`SmilChr04G003731`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor DUO1
产物	transcription factor DUO1
Arabidopsis	`AT3G60460` (DUO1) myb-like HTH transcriptional regulator family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825217] identity=48.4; qcov=1.07; evalue=5.87e-74; confidence=high
Rice	`Os06g0679400` - identity=53.3; qcov=0.375; evalue=2.37e-37; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF13921 (Myb_DNA-bind_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020609

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805511.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805511.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805511.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057805511.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057805511.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53626569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B91,C44,C83
`Chr4:53626570`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B91,C44,C83
`Chr4:53626678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B127,B31,B75
`Chr4:53627118`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr4:53627318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr4:53627515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B36,B4
`Chr4:53627549`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B91,C44,C83
`Chr4:53627597`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C39,C43,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805511.1

285 aa

142

285

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

Myb_DNA-binding

Myb_DNA-bind_6

PF00249 Myb_DNA-binding 19-64 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 22-72 aa PF00249 Myb_DNA-binding 74-115 aa PF13921 Myb_DNA-bind_6 76-116 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805511.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	19	64	2.3e-28	98.7	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057805511.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	22	72	8.1e-19	68.3	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057805511.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	74	115	2.3e-28	98.7	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057805511.1`	Pfam	`PF13921`	Myb_DNA-bind_6	Domain	76	116	8.1e-19	68.3	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949528.1
GTTGGGAAAAGCCCGAAATTCAAATGAGAGAGAAAGGGGGAAAGCGGGGTAATTTAGTGGGGATAGTGGGAATAACCGTCTCAACCGCCACTCTCGCAAATTCTCACACACACACACACACACTAGTAAGAGATACATAGATACAAACACCCAGTATTATGTGTCACTCCAAACAAAATCCGCAGATAATAATTAAGCAAAAGCCCAAAAATCCAGACGCAATCCCATCTCCTCGACTTGGAAATCAAGCGGCATTTCAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020609
ATGATGGAAGGCAAGAGAAGGATGGCGCACGACGATGAACTGCGCGATATAAAGAAAGGTCCATGGAAAGTGGAAGAGGACGAAGTCCTCATAAACCACGTGAAGAAATACGGCCCCCGCGATTGGAGCTCCATTCGATCCAAAGGCCTCCTCCGCCGCACCGGCAAGTCCTGCCGCCTCCGCTGGGTCAACAAACTCCGCCCTGACTTGAAGACGGGGATGAAGTTCTCGGCCGATGAGGAGAGGACGGTGATCGATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805511.1
MMEGKRRMAHDDELRDIKKGPWKVEEDEVLINHVKKYGPRDWSSIRSKGLLRRTGKSCRLRWVNKLRPDLKTGMKFSADEERTVIDLQAQFGNKWAKIATYLQGRTDNDVKNFWSSRQKRLARILHTSTAPSSSKSHKTTKHLQTPPFDFIPSLKATKLEEEFAASSMETVPFGEVVYPSPISAVPVEQQPYVAFPQFPMLPPDYPPLLEGQDFIGRLGAPSFLDDELGHSALGTAQVPIAPSFQASGTSESHDAVDIDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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