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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003732`

染色体: Chr04 坐标: 53627892-53630218 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003732`
名称	SmilChr04G003732
描述	uncharacterized SmilChr04G003732
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53627892 - 53630218 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020610`
GeneID	`131020610`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020610`
原始查询	`SmilChr04G003732`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Phosphoglycerate mutase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825216]; symbol=AT3G60450; hit=AT3G60450; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Phosphoglycerate mutase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825216]; symbol=AT3G60450; hit=AT3G60450; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G60450` (AT3G60450) Phosphoglycerate mutase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825216] identity=57.4; qcov=0.888; evalue=9.22e-99; confidence=high
Rice	`Os03g0101500` - identity=52; qcov=0.85; evalue=3.6e-73; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00300 (His_Phos_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020610

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057805512.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057805512.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057805512.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805512.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805512.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53628079`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B31,C73
`Chr4:53628088`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B22,B48,C70
`Chr4:53628214`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B106,C53,D11
`Chr4:53628538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805512.1

267 aa

134

267

His_Phos_1

PF00300 His_Phos_1 17-87 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805512.1`	Pfam	`PF00300`	His_Phos_1	Domain	17	87	3.6e-11	43.8	Histidine phosphatase superfamily (branch 1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949529.1
GCAGTATAAAAAGGAGAGGAGAGTCATAGTCCATTCGGAGCGAAAAGAGGGCACTTTCTCACTCTAAGAATCTCTCTTTGCACCAAATCTATTTGATGGGTTTGTCCGATGGCGATGGCTCCTCCCAGTTCCGCCAAAACGTCGTCGTAATGCGCCACGGCGACAGGCTCGACAACGCCGTCCCTCTCTGGGCGGCGTCCGCGCCCCGCCCCTGGGATCCCCCGCTCGCCGACGACGGCCACGTCCGGGCCTACTCCACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020610
ATGGGTTTGTCCGATGGCGATGGCTCCTCCCAGTTCCGCCAAAACGTCGTCGTAATGCGCCACGGCGACAGGCTCGACAACGCCGTCCCTCTCTGGGCGGCGTCCGCGCCCCGCCCCTGGGATCCCCCGCTCGCCGACGACGGCCACGTCCGGGCCTACTCCACCGGCGATAAGCTCAGGAAGCAGCTCTCTTTTCCGATCCACCGCGTCTTCGTTTCCCCATTCTTACGCTGCCTCCAGACTGCCTCCGGAGTCGTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805512.1
MGLSDGDGSSQFRQNVVVMRHGDRLDNAVPLWAASAPRPWDPPLADDGHVRAYSTGDKLRKQLSFPIHRVFVSPFLRCLQTASGVVSALCAVDRKSDDPNDLTSNGVVIDPSKIKVSMEYGLCEMMNSLAIRPNVAPKDGIFSFDTSQCKSVLPAGTIDNSTEMVYKELPRWQETLDGARARYVQVITSLADKYPSENLLLVTHGEGVGSSVAGCFEDVEVAEVEYCAYSILQRSVVFKENKLFTAGNFVGSLKDLAGVQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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