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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003733`

染色体: Chr04 坐标: 53635987-53638582 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003733`
名称	SmilChr04G003733
描述	chaperone protein dnaJ 39-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53635987 - 53638582 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020611`
GeneID	`131020611`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020611`
原始查询	`SmilChr04G003733`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	chaperone protein dnaJ 39-like
产物	chaperone protein dnaJ 39-like
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0648400` (OsDjA4) - identity=57.5; qcov=0.373; evalue=1.66e-08; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020611

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057805515.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057805517.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057805513.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057805513.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805515.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53636063`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	43	A13,A14,A15,A16,A23,A3,B10,B101,B102,B12,B120,B131,B136,B137,B15,B24,B25,B29,B41,B42,B43,B46,B53,B55,B84,B85,B98,C18,C2,C3,C35,C40,C42,C57,C6,C61,C62,C64,C65,C66,C72,C78,D5
`Chr4:53636079`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	26	A2,A4,B124,B128,B21,B28,B29,B30,B36,B45,B47,B49,B6,B60,B70,B82,C17,C21,C32,C36,C58,C63,C68,C77,C80,D9
`Chr4:53636146`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B104,B31,C73
`Chr4:53636147`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	17	A13,A25,B11,B129,B139,B26,B37,B47,B86,C20,C29,C52,C6,C7,C76,C78,D1
`Chr4:53636178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	89	A1,A10,A15,A20,A25,A7,B1,B10,B105,B107,B111,B112,B113,B114,B115,B121,B123,B126,B129,B13,B132,B134,B135,B139,B14,B140,B17,B2,B20,B25,B38,B39,B4,B40,B49,B51,B55,B56,B58,B6,B61,B63,B66,B69,B7,B70,B74,B75,B76,B79,B8,B80,B83,B87,B88,B89,B93,B96,B97,B99,C10,C14,C17,C18,C20,C22,C24,C26,C28,C33,C34,C4,C40,C43,C47,C5,C51,C55,C59,C61,C67,C75,C79,C81,C85,C86,C87,D11,D5
`Chr4:53636187`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B106
`Chr4:53636187`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B106
`Chr4:53636731`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A24,B42,B43,B75,C2,C54,C64,C66,D1
`Chr4:53636739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B97
`Chr4:53636810`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A15,B126,B132,C24,C47,C61,C85
`Chr4:53636939`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	124	A11,A13,A14,A15,A16,A18,A20,A22,A23,A24,A3,A6,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B106,B108,B109,B113,B117,B118,B12,B120,B122,B126,B130,B131,B132,B136,B137,B140,B15,B17,B18,B19,B22,B24,B25,B27,B29,B3,B31,B35,B36,B38,B39,B41,B42,B43,B46,B48,B50,B53,B55,B56,B60,B62,B63,B64,B67,B71,B72,B75,B77,B78,B8,B81,B84,B85,B91,B96,B98,B99,C11,C12,C13,C15,C16,C18,C2,C21,C24,C27,C3,C33,C35,C37,C38,C39,C40,C42,C44,C47,C48,C49,C52,C54,C55,C57,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C69,C72,C77,C78,C79,C8,C81,C83,C85,D1,D10,D5,D6,D7
`Chr4:53636976`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	104	A11,A13,A14,A15,A16,A18,A20,A23,A24,A3,A6,A8,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B106,B108,B113,B12,B120,B122,B126,B130,B131,B132,B136,B137,B140,B15,B19,B22,B24,B25,B27,B29,B3,B31,B36,B38,B39,B41,B42,B43,B46,B48,B50,B53,B55,B56,B60,B62,B63,B64,B67,B71,B72,B75,B78,B81,B84,B85,B91,B96,B98,B99,C11,C12,C13,C16,C18,C2,C24,C3,C33,C35,C39,C40,C42,C44,C47,C48,C52,C54,C57,C6,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C69,C72,C78,C8,C83,C85,D1,D10,D5,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805515.1

127 aa

127

DnaJ

PF00226 DnaJ 86-126 aa

XP_057805516.1

127 aa

127

DnaJ

PF00226 DnaJ 86-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805515.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	86	126	8.8e-09	36.1	DnaJ domain
`XP_057805516.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	86	126	8.8e-09	36.1	DnaJ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

10 records

下载 cDNA FASTA

XR_009100724.1
ATGTAACTCACTTGAGCTAGAGCTGTAATTCAGCAATGGCGAAACTGGAAATGCAATGAAATGGAAGAAAAATGAAGAAAATAGAGTTGTCGCGAATGGCGCAGTTGAAGGTTACTGTTTCTGGGATGGCGCCAGCACCGTCAAATTTGAGTGGGGCGTCGCCGGATTTAAAAGGGGACACTCCTCCACTGCAACCTCATGCCGTCGCCATGGCTCCCCTCTTTGTGAAATATATACATTTTCACTTGGATAGGACTGAA...

XR_009100725.1
GCTGTAATTCAGCAATGGCGAAACTGGAAATGCAATGAAATGGAAGAAAAATGAAGAAAATAGAGTTGTCGCGAATGGCGCAGTTGAAGGTTACTGTTTCTGGGATGGCGCCAGCACCGTCAAATTTGAGTGGGGCGTCGCCGGATTTAAAAGGGGACACTCCTCCACTGCAACCTCATGCCGTCGCCATGGCTCCCCTCTTTGTGAAATATATACATTTTCACTTGGATAGGACTGAAACAAAGTCATTCTTTGGAGGA...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC131020611
ATGAAGAAAATAGAGTTGTCGCGAATGGCGCAGTTGAAGGTTACTGTTTCTGGGATGGCGCCAGCACCGTCAAATTTGAGTGGGGCGTCGCCGGATTTAAAAGGGGACACTCCTCCACTGCAACCTCATGCCGTCGCCATGGCTCCCCTCTTTGTGAAATATATACATTTTCACTTGGATAGGACTGAAACAAAGTCATTCTTTGGAGGAGCTAGAAGGAAAATCAATGACCTAAAGCATTACGAAATTCTTTGTGATGA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057805513.1
MKKIELSRMAQLKVTVSGMAPAPSNLSGASPDLKGDTPPLQPHAVAMAPLFVKYIHFHLDRTETKSFFGGARRKINDLKHYEILCDELKKAYRKATIKNHPDKSGDGKASPLSFQFISYALWTVCIECTSHKKRCRTVVD

XP_057805515.1
MKKIELSRMAQLKVTVSGMAPAPSNLSGASPDLKGDTPPLQPHAVAMAPLFVKYIHFHLDRTETKSFFGGARRKINDLKHYEILCDELKKAYRKATIKNHPDKSGDGKIKELAQSYEVLIEPEKRSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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