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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003749`

染色体: Chr04 坐标: 53771689-53775979 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003749`
名称	SmilChr04G003749
描述	vesicle-associated protein 1-2-like
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53771689 - 53775979 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020630`
GeneID	`131020630`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020630`
原始查询	`SmilChr04G003749`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vesicle-associated protein 1-2-like
产物	vesicle-associated protein 1-2-like
Arabidopsis	`AT1G51270` (AT1G51270) vesicle-associated protein 1-4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841550] identity=53; qcov=0.894; evalue=3.03e-112; confidence=high
Rice	`Os04g0534400` - identity=71; qcov=0.414; evalue=2.64e-73; confidence=low
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0061817 (GO:0061817); GO:0090158 (endoplasmic reticulum membrane organization)
KEGG	-
Pfam	PF00635 (Motile_Sperm)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020630

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057805546.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057805546.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057805546.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805546.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805546.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53772558`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A5,B37,B48,B57,B90,B92,C53,C74
`Chr4:53772931`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,B101,B132,C23
`Chr4:53773946`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,B77,B91
`Chr4:53774234`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B77,B91,C42,D6
`Chr4:53774419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:53774448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B114
`Chr4:53774448`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr4:53774772`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	26	A14,A15,B106,B108,B118,B131,B133,B16,B37,B41,B56,B62,B64,B94,B96,B99,C15,C19,C2,C28,C38,C40,C47,C54,C61,D4
`Chr4:53774781`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	C1,C36,C46,C47,C62
`Chr4:53775078`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr4:53775083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr4:53775292`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805546.1

367 aa

184

367

Motile_Sperm

PF00635 Motile_Sperm 39-142 aa PF00635 Motile_Sperm 215-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805546.1`	Pfam	`PF00635`	Motile_Sperm	Domain	39	142	7.8e-63	209.9	MSP (Major sperm protein) domain
`XP_057805546.1`	Pfam	`PF00635`	Motile_Sperm	Domain	215	306	7.8e-63	209.9	MSP (Major sperm protein) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949563.1
TACATTTCAATGTTCTTCTCATAAATTATCAATTGATTATCTTTGTTGCCAATTGTTTTCATCGATTCACCAAAGAAGATCAAAGTGATTCTCCTCTTATCTTGACACCAGTTAAATTAACTGAAGGGCCAAACTGTAATTTACACAACTGCAGGGCCAAAGTGTAATGGGCCAAAGTGTAATTAGCCTTAAATTAATATCGCCTTCCGCCGTGAAATGGGGGGGAGGGGAATTGGATTCAAGCTCCGCCGCGGCTATCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020630
ATGGGGGGGAGGGGAATTGGATTCAAGCTCCGCCGCGGCTATCCGGAACCTTTAACACCGACAGTTATCCGGCGGCCAGCAGCGATCCGCTTAGAGACGAGTAACTGCGAGCTCCTTCAAATTGAACCTCGCCAACTTCAATTCCCATTCGAATTGAAGAAGCAGATCTCATGCTCGATGCAATTGACGAACAAGTCTGGGAATCATGTTGCATTCAAGGTGAAGACAACAAATCCGAAGAAGTACTGTGTGAGGCCAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805546.1
MGGRGIGFKLRRGYPEPLTPTVIRRPAAIRLETSNCELLQIEPRQLQFPFELKKQISCSMQLTNKSGNHVAFKVKTTNPKKYCVRPNTGVVMPYSSCDVTVTMQAQKEAPPDMQCRDKFLLHSVVVNPGISAKDITPKMFNKELGNQVDECKLKVAYVPPPQPPSPVREGSEEGSFPRASLSENWNVNQMLESLTRSIIWRTAAIRLEMSNYDLLQIDPLELQFPFELKKQISCSMQLTNKSEKHVAFKVKTTNPKKFCV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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