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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003750`

染色体: Chr04 坐标: 53781289-53789135 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003750`
名称	SmilChr04G003750
描述	uncharacterized SmilChr04G003750
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53781289 - 53789135 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023620`
GeneID	`131023620`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023620`
原始查询	`SmilChr04G003750`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vesicle associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825231]; symbol=VAP27-1; hit=AT3G60600; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	vesicle associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825231]; symbol=VAP27-1; hit=AT3G60600; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G60600` (VAP27-1) vesicle associated protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825231] identity=68.6; qcov=0.487; evalue=7.89e-110; confidence=medium
Rice	`Os04g0534400` - identity=62.3; qcov=0.491; evalue=8.98e-100; confidence=medium
GO	GO:0005789 (endoplasmic reticulum membrane); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0061817 (GO:0061817); GO:0090158 (endoplasmic reticulum membrane organization)
KEGG	-
Pfam	PF00635 (Motile_Sperm)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023620

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	0.80000	`XP_057809145.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057809145.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057809145.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.40000	`XP_057809145.1`
5	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057809145.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53782104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr4:53782137`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A11
`Chr4:53782376`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A11,B77,B91,C42,D6
`Chr4:53782705`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C10
`Chr4:53782725`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C58
`Chr4:53782748`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr4:53787576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B119,B22,C56
`Chr4:53787733`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B100,B140,B49,B62,C36
`Chr4:53788795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr4:53788796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A20,B43
`Chr4:53788874`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B67

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809145.1

497 aa

248

497

Motile_Sperm

PF00635 Motile_Sperm 7-111 aa PF00635 Motile_Sperm 265-369 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809145.1`	Pfam	`PF00635`	Motile_Sperm	Domain	7	111	6.9e-66	219.7	MSP (Major sperm protein) domain
`XP_057809145.1`	Pfam	`PF00635`	Motile_Sperm	Domain	265	369	6.9e-66	219.7	MSP (Major sperm protein) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953162.1
TAATCTTAAATTATTCATATTTTAATAGACGCATTGCACTTTCCACGTTTGCGTAATTTATTTCTCTTCCACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAACCGGAAGAAAAGCCAGCACAAAATTTCCTAAATTTCGAAAACCCCAGATCTCTCTCCTCCTTCGCCTCCTAATTAATATCGCTTTCCGCCGTGAAACGGTGATTGGATTCAATCTCCGCCGCCGACAGCCGGAATCTTTAACGCGATCAGTTATCCGGCGGACTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023620
ATGAGTACCTGCGAGCTCCTTGAAATTGAACCTCTCGAACTTCAATTCGCATTCGAATTGAAGAAGCAGATCTCATGTTCGATGCAATTGACGAACAAGTCTGAGAATCATGTTGCATTCAAGGTGAAGACAACAAATCCGAAGAAGTACTGTGTGAGGCCAAACACTGGAGTCGTGATGCCACACTCTAGTTGTGATGTCACAGTTACCATGCAAGCCCAAAAAGAGGCTCCACCGGATATGCAATGCAGGGATAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809145.1
MSTCELLEIEPLELQFAFELKKQISCSMQLTNKSENHVAFKVKTTNPKKYCVRPNTGVVMPHSSCDVTVTMQAQKEAPPDMQCRDKFLLQSVVVNPGVSAKDITPEMFNKDSGNQVDECKLRVAYVPPPQPPSPVREGSEEGSSPRASVSENGTVNQSSDLNVMSKGFPETNEVTSEVKALILKLTEEKQSAIQQNNRLQQELELVRRQGQGQKSAGGVPIMYVIIVSLIGILLGYLLKRPEFLTRSICRRTAAIRVEMS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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