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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003773`

染色体: Chr04 坐标: 53926163-53928449 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003773`
名称	SmilChr04G003773
描述	uncharacterized SmilChr04G003773
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53926163 - 53928449 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020718`
GeneID	`131020718`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020718`
原始查询	`SmilChr04G003773`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0134900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0134900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G45380` (AT2G45380) myeloid leukemia factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819145] identity=39; qcov=1.12; evalue=1.3e-39; confidence=medium
Rice	`Os06g0134900` - identity=36.5; qcov=1.18; evalue=4.11e-42; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10248 (Mlf1IP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020718

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057805703.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057805703.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805703.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805703.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805703.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53926382`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr4:53926406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C12
`Chr4:53926411`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	7	B127,B23,B51,C27,C73,C85,D4
`Chr4:53927000`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B19
`Chr4:53927013`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B91
`Chr4:53927171`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B52,B83,C59,D10
`Chr4:53927850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B21,B23,B71

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805703.1

235 aa

118

235

Mlf1IP

PF10248 Mlf1IP 90-173 aa

XP_057805704.1

235 aa

118

235

Mlf1IP

PF10248 Mlf1IP 90-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805703.1`	Pfam	`PF10248`	Mlf1IP	Family	90	173	5.2e-14	53.3	Myelodysplasia-myeloid leukemia factor 1-interacting protein
`XP_057805704.1`	Pfam	`PF10248`	Mlf1IP	Family	90	173	5.2e-14	53.3	Myelodysplasia-myeloid leukemia factor 1-interacting protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949721.1
ATTCAATTTCGAATTTTTTGGTCATCCGTAATTGGCATGCATCATTTTGTTTTATTTCTGTTAGCTTTTCCAGAAGTTTCTACCGCATTCTTCTTAGCTAGCCTGCCACTGCCAGTTTCTTCATCACTCTACTAGTCTACTCTCTCTCTCTCTCCGTCTATCGCTAGATAAAGAGCGTTTCAAGAATTGCATACGATGTCGTTTTTTGGAGGGAAAGATCCATTCGATCACCCGTTCTTCACTCAGCCTTTCGGTGGCTT...

XM_057949720.1
TTGGCATGCATCATTTTGTTTTATTTCTGTTAGCTTTTCCAGAAGTTTCTACCGCATTCTTCTTAGCTAGCCTGCCACTGCCAGTTTCTTCATCACTCTACTAGTCTACTCTCTCTCTCTCTCCGTCTATCGCTAGATAAAGCCACCTCACAATCACAGAGCGTTTCAAGAATTGCATACGATGTCGTTTTTTGGAGGGAAAGATCCATTCGATCACCCGTTCTTCACTCAGCCTTTCGGTGGCTTGTTTGGTGGGACGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC131020718
ATGTCGTTTTTTGGAGGGAAAGATCCATTCGATCACCCGTTCTTCACTCAGCCTTTCGGTGGCTTGTTTGGTGGGACGAATCCGTTTGCTGATCCGTTTTTCACCAGCAATTTTGGTAGAAATTCGGGTCCCCGCAAGCAAATTTCCATTGAAGAGCTGAACCCTGATGATGCTGGCGGCAATGATGCTAAAAGTGAACTCTCTGTTAAGAATTGGAGTGAATCTCCATCAGATTATCAGAGCTTTAGCTTCCAGAGAGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057805703.1
MSFFGGKDPFDHPFFTQPFGGLFGGTNPFADPFFTSNFGRNSGPRKQISIEELNPDDAGGNDAKSELSVKNWSESPSDYQSFSFQRVAYGGPDGMYYTSSVGKRTGGDGVFLMEMKEDDQMVGESLHTISKGIHDKGHSVTTKQSKDGRVDSLQTLHNLEEDELAGFEENWKTSAENVLPGWSSGFNLLENAGANNSGWDDFGGWGGWPFQSLEYYGDDHGESREPSSRRIVPVE

XP_057805704.1
MSFFGGKDPFDHPFFTQPFGGLFGGTNPFADPFFTSNFGRNSGPRKQISIEELNPDDAGGNDAKSELSVKNWSESPSDYQSFSFQRVAYGGPDGMYYTSSVGKRTGGDGVFLMEMKEDDQMVGESLHTISKGIHDKGHSVTTKQSKDGRVDSLQTLHNLEEDELAGFEENWKTSAENVLPGWSSGFNLLENAGANNSGWDDFGGWGGWPFQSLEYYGDDHGESREPSSRRIVPVE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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