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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003775`

染色体: Chr04 坐标: 53940086-53941294 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003775`
名称	SmilChr04G003775
描述	putative B3 domain-containing protein REM15
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	53940086 - 53941294 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131023624`
GeneID	`131023624`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131023624`
原始查询	`SmilChr04G003775`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative B3 domain-containing protein REM15
产物	putative B3 domain-containing protein REM15
Arabidopsis	`AT4G00260` (MEE45) Transcriptional factor B3 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828225] identity=29.7; qcov=0.995; evalue=3.77e-12; confidence=low
Rice	`Os08g0325134` - identity=31.1; qcov=0.443; evalue=4.21e-12; confidence=low
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02362 (B3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131023624

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057809149.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057809149.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057809149.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057809149.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057809149.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:53940097`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,B59,C27,D6
`Chr4:53940110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr4:53940131`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	86	A1,A10,A11,A13,A21,A22,A24,A25,A6,A8,B100,B102,B103,B11,B112,B115,B117,B119,B123,B124,B125,B127,B13,B130,B131,B135,B136,B137,B138,B14,B17,B18,B24,B25,B29,B31,B32,B41,B44,B52,B54,B56,B59,B6,B60,B61,B69,B78,B79,B80,B81,B83,B84,B86,B89,B9,B90,B92,B95,B96,C12,C13,C14,C17,C19,C2,C21,C22,C31,C43,C48,C54,C55,C56,C58,C6,C62,C64,C66,C67,C75,C81,C87,C9,D10,D11
`Chr4:53940161`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B99,C74,C86
`Chr4:53940162`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B106,B62
`Chr4:53940182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr4:53940201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,B46
`Chr4:53940225`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A9,B106,B132,B22,B53,B62,B71,B73,B75,B93,C15,C36,C4,C40,C42,C53,D7
`Chr4:53940236`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	B1,B134,B2,B38,B39,B42,B43,B94,C13,C26,C48,C54,C64,D1
`Chr4:53940255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,C74,C86
`Chr4:53940262`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	37	A20,A22,A25,A5,A8,B106,B108,B112,B121,B132,B19,B26,B31,B34,B37,B47,B48,B53,B59,B61,B62,B71,B8,B92,B93,C15,C2,C27,C36,C46,C53,C72,C82,C87,D3,D6,D7
`Chr4:53940268`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,C74,C86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057809149.1

203 aa

102

203

PF02362 B3 15-94 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057809149.1`	Pfam	`PF02362`	B3	Domain	15	94	1.7e-24	86.4	B3 DNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057953166.1
ATGGCCTCTACACCTAAGTTCTGCAAGTGTTTGTTTGAGCTAAATCGCAATTTTGGATTGCCTCAAGCTTTCATGGAAAAGTACAACGAAATCTTGCCGGAAGAAGTCGAGCTAAGAATCAGCGGTGGCGCTACATGGAAGGTATGGGTGGAGAAACTCGAAGAAGGCGGCGGTTACTTGTTCACGAGAGGATGGGCCAAATTCTGTCGAGACATGGGGCTTCAAATCTCCGACACGCTTGTCTTTTCCTACTCGGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131023624
ATGGCCTCTACACCTAAGTTCTGCAAGTGTTTGTTTGAGCTAAATCGCAATTTTGGATTGCCTCAAGCTTTCATGGAAAAGTACAACGAAATCTTGCCGGAAGAAGTCGAGCTAAGAATCAGCGGTGGCGCTACATGGAAGGTATGGGTGGAGAAACTCGAAGAAGGCGGCGGTTACTTGTTCACGAGAGGATGGGCCAAATTCTGTCGAGACATGGGGCTTCAAATCTCCGACACGCTTGTCTTTTCCTACTCGGGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057809149.1
MASTPKFCKCLFELNRNFGLPQAFMEKYNEILPEEVELRISGGATWKVWVEKLEEGGGYLFTRGWAKFCRDMGLQISDTLVFSYSGNSAFDVSVFLSTGLEKELDIGASATKGGEQTDSGATGNPRFPFVLKPSNYSKMRLPTDFVKAHGLSGGMKLWLEYYPGGGKYEEARLVLAKERPPRVMVNGGWVSFCKTNNLTPGKT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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