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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003822`

染色体: Chr04 坐标: 54343952-54347830 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003822`
名称	SmilChr04G003822
描述	cell division protein FtsY homolog, chloroplastic
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54343952 - 54347830 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020685`
GeneID	`131020685`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020685`
原始查询	`SmilChr04G003822`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cell division protein FtsY homolog, chloroplastic
产物	cell division protein FtsY homolog%2C chloroplastic
Arabidopsis	`AT2G45770` (CPFTSY) signal recognition particle receptor protein, chloroplast (FTSY) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819185] identity=78; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0958100` (OJ1294_F06.26-1) - identity=78.9; qcov=0.852; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005047 (signal recognition particle binding); GO:0005525 (GTP binding); GO:0006614 (SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane); GO:0016020 (membrane); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	smil03060 (Protein export - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00448 (SRP54); PF02881 (SRP54_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020685

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057805647.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	1.00000	`XP_057805647.1`
3	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057805647.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057805647.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805647.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54344022`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B138,C64
`Chr4:54344055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr4:54344124`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr4:54344138`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C35
`Chr4:54344139`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B2,B55,B73,B75
`Chr4:54344217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130
`Chr4:54345270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B100,B72,C46,D11
`Chr4:54345387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr4:54346174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr4:54346193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B60,B68
`Chr4:54346343`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr4:54346457`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C46

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805647.1

372 aa

186

372

SRP54_N

SRP54

PF02881 SRP54_N 99-148 aa PF00448 SRP54 170-371 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805647.1`	Pfam	`PF02881`	SRP54_N	Domain	99	148	1.2e-08	35.7	SRP54-type protein, helical bundle domain
`XP_057805647.1`	Pfam	`PF00448`	SRP54	Domain	170	371	1.3e-72	244.3	SRP54-type protein, GTPase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949664.1
AATTCCGAAGGTTGGAAGTTTATCCATTGAGACAGCTCTCATCAACTACCCAGAAAATCAAGAATGTCATCTTCGCTGCCTTCTCGCCTCTCTCCTCTCCCCTCCAAGCCGCTGCCGCCGCGGGCCACTTCCGCCGCCACCCTCCTCCACTTTCCATCGGACCTCCAATATGCTTCCGCTTCCAGAGCCTCCCGCTTCAAGTGCTCCGCCGGAGAGGCCGGGTTCTTCACCAAACTCGGCCGCTTGATCAAAGAAAAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020685
ATGTCATCTTCGCTGCCTTCTCGCCTCTCTCCTCTCCCCTCCAAGCCGCTGCCGCCGCGGGCCACTTCCGCCGCCACCCTCCTCCACTTTCCATCGGACCTCCAATATGCTTCCGCTTCCAGAGCCTCCCGCTTCAAGTGCTCCGCCGGAGAGGCCGGGTTCTTCACCAAACTCGGCCGCTTGATCAAAGAAAAAGCCAAAAGCGATGTGGAGAAAATCTTTTCTGGGTTTTCCAAAACAAGAGACAATTTAGCTGTTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805647.1
MSSSLPSRLSPLPSKPLPPRATSAATLLHFPSDLQYASASRASRFKCSAGEAGFFTKLGRLIKEKAKSDVEKIFSGFSKTRDNLAVVDELLLYWNLSDTDKVLDELEEVLLVADFGPRITIKIVESLRDDIYSGKLKSGTEIKDALKKNILNLLTAKGLKTELKLGFRKPAVIMVVGVNGGGKTTSLGKLANRFKNEGTKVLLAAGDTFRAAASDQLEIWAQRTGCEIVVAEKENAKAATVLSQAVKRGKAEGYDVVLCD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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