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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003824`

染色体: Chr04 坐标: 54354338-54356433 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003824`
名称	SmilChr04G003824
描述	uncharacterized SmilChr04G003824
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54354338 - 54356433 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020728`
GeneID	`131020728`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020728`
原始查询	`SmilChr04G003824`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Thioesterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825292]; symbol=AT3G61200; hit=AT3G61200; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Thioesterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825292]; symbol=AT3G61200; hit=AT3G61200; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT3G61200` (AT3G61200) Thioesterase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825292] identity=50.8; qcov=0.731; evalue=2.1e-43; confidence=medium
Rice	`Os07g0462700` (OJ1634_H04.108) - identity=42.8; qcov=0.909; evalue=5.67e-37; confidence=medium
GO	GO:0047617 (fatty acyl-CoA hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03061 (4HBT); PF13622 (4HBT_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020728

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057805721.1`
2	Peroxisome	过氧化物酶体	0.60000	`XP_057805721.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057805721.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805721.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805721.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54354641`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B56,B96
`Chr4:54354654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B131,B135,B41,B57
`Chr4:54354695`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,A9,B21,C1,C55
`Chr4:54355226`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C1
`Chr4:54355226`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C1
`Chr4:54356127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805721.1

175 aa

175

4HBT

4HBT_3

PF03061 4HBT 82-156 aa PF13622 4HBT_3 82-167 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805721.1`	Pfam	`PF03061`	4HBT	Domain	82	156	2e-09	38.4	Thioesterase superfamily
`XP_057805721.1`	Pfam	`PF13622`	4HBT_3	Domain	82	167	1.2e-07	32.6	Acyl-CoA thioesterase N-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949738.1
AATTAGTGGAGGGAGGGAGTAATTGGGCATCTTCTCAAGAATTTTATCCCTCTCTAATTAGCAAAATTAGACCAAAAGCAAAAGAGGGATGGATAATTGAACCAGTTATAGGACTTTGTGGTAGAGAGTAGAGAGAGAATGACGACAACAAAAGAATCTCCGGCGGTGGCAGCTGCCTCAATCTCCATTGATGTACCTGCGGAATACTCCAAAGCAGTCATTCAATTTGTCAATCGAATGGGAGCTGCTGAAACATTCAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020728
ATGACGACAACAAAAGAATCTCCGGCGGTGGCAGCTGCCTCAATCTCCATTGATGTACCTGCGGAATACTCCAAAGCAGTCATTCAATTTGTCAATCGAATGGGAGCTGCTGAAACATTCAAACCACAACACAACGTGGACGACGCTTTCTCCAACCTTATAGGAGGAGTTCTTAAGGTTATCTCAATCGAAAGGGGAAAACTCTCCTGCTCCCTCGATGTCAAGGCTCCAATTTTGAATGCTTATGGTGGAATGCATGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805721.1
MTTTKESPAVAAASISIDVPAEYSKAVIQFVNRMGAAETFKPQHNVDDAFSNLIGGVLKVISIERGKLSCSLDVKAPILNAYGGMHGGAVGAVAERVAIACARTVVGEDKDLFLGELGLSYLSAALHNAEVIIDAHVVRSGRNLTVVAVNFRLKGSGRLAFLTRATFYNMPVSSL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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