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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003847`

染色体: Chr04 坐标: 54469956-54473509 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003847`
名称	SmilChr04G003847
描述	uncharacterized SmilChr04G003847
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54469956 - 54473509 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020670`
GeneID	`131020670`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020670`
原始查询	`SmilChr04G003847`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	O-glucosyltransferase rumi-like protein (DUF821) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824059]; symbol=AT3G48980; hit=AT3G48980; species=arabidopsis; confidence=high
产物	O-glucosyltransferase rumi-like protein (DUF821) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824059]; symbol=AT3G48980; hit=AT3G48980; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G48980` (AT3G48980) O-glucosyltransferase rumi-like protein (DUF821) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824059] identity=53.2; qcov=0.934; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0642700` - identity=54.1; qcov=0.823; evalue=3.2e-170; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05686 (Glyco_transf_90)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020670

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057805625.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057805625.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805625.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805625.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805625.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54470016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr4:54470019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr4:54470396`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B89
`Chr4:54470396`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B89
`Chr4:54470442`	`C`	`CAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	86	A10,A11,A16,A18,A20,A23,A8,B105,B107,B11,B111,B112,B113,B114,B115,B118,B119,B122,B125,B127,B128,B13,B130,B131,B134,B15,B16,B2,B24,B25,B26,B33,B34,B41,B44,B52,B56,B59,B60,B63,B68,B7,B70,B74,B80,B83,B88,B90,B92,B93,B98,B99,C12,C18,C2,C24,C25,C26,C29,C3,C30,C36,C38,C39,C44,C45,C46,C48,C55,C59,C64,C65,C66,C71,C72,C76,C77,C8,C80,C81,C85,C87,C9,D1,D8,D9
`Chr4:54470443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B106,C87
`Chr4:54470444`	`CGG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	86	A10,A11,A16,A18,A20,A23,A8,B105,B107,B11,B111,B112,B113,B114,B115,B118,B119,B122,B125,B127,B128,B13,B130,B131,B134,B15,B16,B2,B24,B25,B26,B33,B34,B41,B44,B52,B56,B59,B60,B63,B68,B7,B70,B74,B80,B83,B88,B90,B92,B93,B98,B99,C12,C18,C2,C24,C25,C26,C29,C3,C30,C36,C38,C39,C44,C45,C46,C48,C55,C59,C64,C65,C66,C71,C72,C76,C77,C8,C80,C81,C85,C87,C9,D1,D8,D9
`Chr4:54470532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B20,C11
`Chr4:54470584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C63
`Chr4:54470588`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A10,B104,B109,B125,B127,B131,B25,B26,B90,B92,C63,C65,C72,C87
`Chr4:54470593`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	14	A10,B104,B109,B125,B127,B131,B25,B26,B90,B92,C63,C65,C72,C87
`Chr4:54470600`	`CG`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B117,B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805625.1

485 aa

242

485

Glyco_transf_90

PF05686 Glyco_transf_90 80-472 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805625.1`	Pfam	`PF05686`	Glyco_transf_90	Family	80	472	1.2e-176	588.2	Glycosyl transferase family 90

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949642.1
ACACACACACACCGACACACGCATTGATGATGAACATCATATTGTTGTCAAGCCCAAGGGCTCCTGCTCTCCCTTTTCTTCTTCTCTCCCTCTTCATTCCTTTGCTGTTTTTCGCCCCACGGATTCTCCTCGGTAATTATGATTCTGTGATTGTCGTTGAGAAACCATCAGCACCAGATCTGGACTGCATGACATGGAATCACACCAAAAAATGCCCCAAATATCACCCAACCTTTTCGCAGGCGGCGAAGCAGCAGAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020670
ATGATGAACATCATATTGTTGTCAAGCCCAAGGGCTCCTGCTCTCCCTTTTCTTCTTCTCTCCCTCTTCATTCCTTTGCTGTTTTTCGCCCCACGGATTCTCCTCGGTAATTATGATTCTGTGATTGTCGTTGAGAAACCATCAGCACCAGATCTGGACTGCATGACATGGAATCACACCAAAAAATGCCCCAAATATCACCCAACCTTTTCGCAGGCGGCGAAGCAGCAGAGTGGATCCGACTGCCCCGAATACTTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805625.1
MMNIILLSSPRAPALPFLLLSLFIPLLFFAPRILLGNYDSVIVVEKPSAPDLDCMTWNHTKKCPKYHPTFSQAAKQQSGSDCPEYFRWIHEDLRHWRNTGITEKMVAGARRSAHFRLTILDGRMYVEKFAEAFQSRVLFTLWGFAQLMERYGGKLPDLELMFNCDDRPVVEAEQYAAAGKIPPPLFKYCADNRTFDIVFPDWSFWGWAELNIQPWSSFLKEMKQGMDNLKWEDRVPYAYWKGNHKVSVQRYKLMQCNLTR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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