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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr04G003848`

染色体: Chr04 坐标: 54479004-54482707 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr04G003848`
名称	SmilChr04G003848
描述	uncharacterized SmilChr04G003848
染色体 / SeqID	Chr04 / NC_080390.1
坐标与链方向	54479004 - 54482707 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC131020672`
GeneID	`131020672`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC131020672`
原始查询	`SmilChr04G003848`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	O-glucosyltransferase rumi-like protein (DUF821) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824059]; symbol=AT3G48980; hit=AT3G48980; species=arabidopsis; confidence=high
产物	O-glucosyltransferase rumi-like protein (DUF821) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824059]; symbol=AT3G48980; hit=AT3G48980; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G48980` (AT3G48980) O-glucosyltransferase rumi-like protein (DUF821) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824059] identity=53.1; qcov=0.933; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0642700` - identity=53.9; qcov=0.831; evalue=1.16e-168; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF05686 (Glyco_transf_90)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:131020672

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057805627.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057805627.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057805627.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057805627.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057805627.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr4:54479064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C73
`Chr4:54479066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B30,C53
`Chr4:54479074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr4:54479077`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr4:54479134`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr4:54479301`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B23
`Chr4:54479301`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B23
`Chr4:54479305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B16,B38,B64,C41
`Chr4:54479441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B65,C71
`Chr4:54479454`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	A2,C5
`Chr4:54479454`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	A2,C5
`Chr4:54479489`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057805627.1

480 aa

240

480

Glyco_transf_90

PF05686 Glyco_transf_90 80-472 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057805627.1`	Pfam	`PF05686`	Glyco_transf_90	Family	80	472	8e-174	578.9	Glycosyl transferase family 90

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057949644.1
GTGAAGTGAAACACACACACACCGACACACGCATTGATGATGAACATCATATTGTTGTCAGGCCCAAGGGCTCCTGCTCTCCTTTTTCTTCTTCTCTCCCTCTTCATTACTTTGCTGTTTTTCGCCCCACGGATTCACCTCGGTAATTATGATTCTGTGATTGCCGTTGAGATACCATCAGTACCAGATCTGGACTGCGTGACATGGAATCACACCAAAAAATGCCCCAAATATCACCCAACCTTTTCGCAGGCGGCGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC131020672
ATGATGAACATCATATTGTTGTCAGGCCCAAGGGCTCCTGCTCTCCTTTTTCTTCTTCTCTCCCTCTTCATTACTTTGCTGTTTTTCGCCCCACGGATTCACCTCGGTAATTATGATTCTGTGATTGCCGTTGAGATACCATCAGTACCAGATCTGGACTGCGTGACATGGAATCACACCAAAAAATGCCCCAAATATCACCCAACCTTTTCGCAGGCGGCGAAGCAGCAGAGTGGATCCGACTGCCCCGAATACTTCCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057805627.1
MMNIILLSGPRAPALLFLLLSLFITLLFFAPRIHLGNYDSVIAVEIPSVPDLDCVTWNHTKKCPKYHPTFSQAAKQQSGSDCPEYFRWIHEDLRHWRNTGITEKMVAGARRSAHFRLTILDGRMYVEKFAEAFQSRVLFTLWGFAQLMTRYGGKLPDLELMFNSVDRPVVKAEQYAAAGKIPPPLFKYCADNRTFDIVFPDWSFWGWAELNIQPWSSFLKEMKQGMDNLKWEDRVPYAYWKGNHKVSVQRYKLMQCNLTR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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